RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHOUQ7L0Q8 258 aa24■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LIX1LQ8IVB5 337 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-HP01893 362 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST1H3AP68431 136 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELFN2Q5R3F8 820 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF684Q5T5D7 378 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST2H3AQ71DI3 136 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa24■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACOXLQ9NUZ1 547 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELOVL5Q9NYP7 299 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC5A6Q9Y289 635 aa24■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR32B1ATL7 298 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 DOK2O60496 412 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSD11B1P28845 292 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 UQCRFS1P47985 274 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R43P59537 309 aa23.99■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB35Q15286 201 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSC22D1Q15714 1073 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 C4orf17Q53FE4 359 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARMCX4Q5H9R4 360 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf78Q8N4C9 275 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF485Q8NCK3 441 aa23.99■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2H1Q9GZK4 316 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 HDHD2Q9H0R4 259 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ISYNA1Q9NPH2 558 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRP12Q9Y561 859 aa23.99■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPP14O95059 124 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPRL1P41146 370 aa23.98■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GRB2P62993 217 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIPNQ5VXI9 398 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR141Q7Z602 305 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGFBP3Q8TAT2 258 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 PELI1Q96FA3 418 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC120Q96HB5 630 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 JKAMPQ9P055 326 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNT11O96014 354 aa23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 STAC2Q6ZMT1 411 aa23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10S1Q8NGN2 331 aa23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKR7LQ8NHP1 331 aa23.97■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NIPAL2Q9H841 368 aa23.97■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 KALRNO60229 2985 aa23.97■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ADORA2A-AS1P86434 159 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACSM1Q08AH1 577 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF774Q6NX45 483 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUBA1AQ71U36 451 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 STEAP2Q8NFT2 490 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 UFD1Q92890 307 aa23.96■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF224Q9NZL3 707 aa23.96■■□□□ 1.43
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABHD16AO95870 558 aa23.95■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HTR5AP47898 357 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASCL1P50553 236 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC58Q4VC31 144 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC46Q96FV0 321 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPALINQ96PE5 141 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMDHD2Q9Y303 409 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa23.94■■□□□ 1.42
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYNGR3O43761 229 aa23.94■■□□□ 1.42
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