RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 NAA40Q86UY6 237 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 ENTHD1Q8IYW4 607 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 CYGBQ8WWM9 190 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 INTS14Q96SY0 518 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 AKAP9Q99996 3911 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 OR6C6A6NF89 314 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 PRR32B1ATL7 298 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 SLC16A6O15403 523 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 ENTPD6O75354 484 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 GOSR1O95249 250 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 GABRB1P18505 474 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 AQP4P55087 323 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 CDC42P60953 191 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 RIPK1Q13546 671 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 SHFQ7M4L6 423 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 GJC3Q8NFK1 279 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 ST7LQ8TDW4 575 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 KCNS3Q9BQ31 491 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 CA10Q9NS85 328 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 FZR1Q9UM11 496 aa7.85□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 C5orf63A6NC05 138 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 CD8AP01732 235 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 DANCRP0C864 163 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 NR4A1P22736 598 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 APLNRP35414 380 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 THBS4P35443 961 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 TEX30Q5JUR7 227 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 APH1BQ8WW43 257 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 FBXW5Q969U6 566 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 RDH12Q96NR8 316 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 ABHD6Q9BV23 337 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 CDH20Q9HBT6 801 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 ADGRL4Q9HBW9 690 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 AMBNQ9NP70 447 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 COPS3Q9UNS2 423 aa7.84□□□□□ -1.15
PDE4D-201ENST00000309641 MYO9AB2RTY4 2548 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 ARID1AO14497 2285 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 PSMD9O00233 223 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 CD53P19397 219 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 PAX7P23759 505 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 NUDT6P53370 316 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 UCP2P55851 309 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 GALK2Q01415 458 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 KEAP1Q14145 624 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 RAB35Q15286 201 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 ADIPOQQ15848 244 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 MST1LQ2TV78 715 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 LRP11Q86VZ4 500 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF611Q8N823 705 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 OR51G2Q8NGK0 314 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 OTOSQ8NHW6 89 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 ADI1Q9BV57 179 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 POFUT1Q9H488 388 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 CENPMQ9NSP4 180 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 F5H5K5 113 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 SMPD2O60906 423 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 PTHP01270 115 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 ALOX5APP20292 161 aa7.83□□□□□ -1.16
PDE4D-201ENST00000309641 HTR1FP30939 366 aa7.83□□□□□ -1.16
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