RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 CA13Q8N1Q1 262 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 OR52H1Q8NGJ2 320 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 SPPL3Q8TCT6 385 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 PBX4Q9BYU1 374 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ASXL3Q9C0F0 2248 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 TUBAL3A6NHL2 446 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 SULT1C2O00338 296 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 SIGLEC6O43699 453 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 OR13C7P0DN81 318 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 SPP1P10451 314 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ALOX5APP20292 161 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 SERPINA2P20848 420 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 TLE3Q04726 772 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM225Q6GV28 225 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 NAA40Q86UY6 237 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 LINC00518Q8N0U6 118 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 AKR1E2Q96JD6 320 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 TEX101Q9BY14 249 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 SHARPINQ9H0F6 387 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 IFT22Q9H7X7 185 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 A0A087WUJ7 227 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 MEGF11A6BM72 1044 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF850A8MQ14 1090 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 HMSDA8MTL9 139 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 CD96P40200 585 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 FMODQ06828 376 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ROBO4Q8WZ75 1007 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 WRBO00258 174 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV1D-16P01601 117 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 OR8U9P0C7N5 309 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 S100A2P29034 98 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 CASRP41180 1078 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 TSFMP43897 325 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 RAB13P51153 203 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 RAB38P57729 211 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 MEF2DQ14814 521 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 STPG1Q5TH74 334 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 DNM1P34Q6PK57 102 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 NAXDQ8IW45 347 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 C10orf90Q96M02 699 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 FAM60AQ9NP50 221 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 FAM86C1Q9NVL1 165 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 FBXO7Q9Y3I1 522 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 DOCK9Q9BZ29 2069 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM218A2RU14 115 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 KLF4O43474 513 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 LRP3O75074 770 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF205O95201 554 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 CSTBP04080 98 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 CRYBA1P05813 215 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 CA3P07451 260 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 PGCP20142 388 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 CD226Q15762 336 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 C4orf45Q96LM5 186 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 OR52A1Q9UKL2 312 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 CACNA1DQ01668 2161 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 SLC17A2O00624 439 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 OIP5O43482 229 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 CXCL10P02778 98 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 OR6K3Q8NGY3 331 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ABHD6Q9BV23 337 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 RHPN2P1A8MT19 583 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ABCD4O14678 606 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 CTDSPLO15194 276 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 NXPH3O95157 252 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 NSA2O95478 260 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 NQO2P16083 231 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 NAGAP17050 411 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 CAV2P51636 162 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ADPRHP54922 357 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ACY1Q03154 408 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 TFF2Q03403 129 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 SLC17A1Q14916 467 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ALG11Q2TAA5 492 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF425Q6IV72 752 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 TSLPQ969D9 159 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 PFDN5Q99471 154 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 TPSD1Q9BZJ3 242 aa13.06□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 OR4C45A6NMZ5 311 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 PRR32B1ATL7 298 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 TRIM77I1YAP6 450 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms