RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 KCNJ3P48549 501 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PLA2G7Q13093 441 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 RIN1Q13671 783 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 SEC22AQ96IW7 307 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 WDPCPO95876 746 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 MSX1P28360 303 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PXKQ7Z7A4 578 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 OR6V1Q8N148 313 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.7□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 GABARAPH6UMI1 98 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PRSS3P35030 304 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 TMEM244Q5VVB8 128 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 APOOLQ6UXV4 268 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 EDAQ92838 391 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PRO1933Q9H354 126 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PPT1P50897 306 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CCR9P51686 369 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 MESTQ5EB52 335 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 RHBDD2Q6NTF9 364 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 OR6N1Q8NGY5 312 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 GPER1Q99527 375 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 AKR7A3O95154 331 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 NQO2P16083 231 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 RAB6AP20340 208 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 C19orf57Q0VDD7 668 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 SLC17A1Q14916 467 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 TMEM65Q6PI78 240 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 OTOSQ8NHW6 89 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ADIPOR1Q96A54 375 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 OR5B2Q96R09 309 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.69□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 HTR3BO95264 441 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 TGM6O95932 706 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 NDUFA6P56556 154 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ZNF546Q86UE3 836 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 KCNJ15Q99712 375 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 MAGEB1P43366 347 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CHAF1BQ13112 559 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 Q5BKY6 102 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CARD17Q5XLA6 110 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 TRILQ7L0X0 811 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 UPRTQ96BW1 309 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 GPR171O14626 319 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 SHOXO15266 292 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 HLA-DQB1P01920 261 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 IGKV3-11P04433 115 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 IFNGR1P15260 489 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 GABRA4P48169 554 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 Q3ZCU0 254 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 OR52I2Q8NH67 350 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 CCDC107Q8WV48 283 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ADAM19Q9H013 955 aa14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.67□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.67□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ZNF43P17038 809 aa14.67□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ALOX5APP20292 161 aa14.67□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 SFTPDP35247 375 aa14.67□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 PRKXP51817 358 aa14.67□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 GPR119Q8TDV5 335 aa14.67□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 OR8B4Q96RC9 309 aa14.67□□□□□ -0.06
CTCF-201ENST00000264010 GAREM1Q9H706 876 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.5 ms