RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 AQP10Q96PS8 301 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 SLC22A13Q9Y226 551 aa19.12■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TERTO14746 1132 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 HRH1P35367 487 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 SSX2Q16385 188 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 LINC00114Q6XXX2 140 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 BEND4Q6ZU67 534 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 OR56B1Q8NGI3 324 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 RNF128Q8TEB7 428 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 DCBLD2Q96PD2 775 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CDC6Q99741 560 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TRIM2Q9C040 744 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 PARP11Q9NR21 331 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 DUSP22Q9NRW4 184 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TMEM74BQ9NUR3 256 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 AMDHD2Q9Y303 409 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 MAP3K8P41279 467 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CYCSP99999 105 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 FAHD2AQ96GK7 314 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CAPNS2Q96L46 248 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 KXD1Q9BQD3 176 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 POMT1Q9Y6A1 747 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ALPK2Q86TB3 2170 aa19.11■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 DCDC2BA2VCK2 349 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 RAB6AP20340 208 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 NDUFA6P56556 154 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ACTBL2Q562R1 376 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 FHL5Q5TD97 284 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TET1Q8NFU7 2136 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 MARCH1Q8TCQ1 289 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CMBLQ96DG6 245 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 H7C1Q1 480 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 PLGP00747 810 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CPMP14384 443 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ZNF765Q7L2R6 523 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 REC114Q7Z4M0 266 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TCEAL8Q8IYN2 117 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 EXD3Q8N9H8 876 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 IRF7Q92985 503 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TGIF2Q9GZN2 237 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 PDE7BQ9NP56 450 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TAS2R4Q9NYW5 299 aa19.1■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 WIPF3A6NGB9 483 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 DPTQ07507 201 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 FAM53BQ14153 422 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 LY6G5CQ5SRR4 150 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TMEM225Q6GV28 225 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ULK3Q6PHR2 472 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TTLL10Q6ZVT0 673 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 RNF44Q7L0R7 432 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CDRT4Q8N9R6 151 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 RCBTB1Q8NDN9 531 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CCDC54Q8NEL0 328 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 OR2L3Q8NG85 312 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 OR10D4PQ8NGN7 298 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ARRDC3Q96B67 414 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 LMAN2LQ9H0V9 348 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 GRXCR1A8MXD5 290 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 CSTBP04080 98 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TSFMP43897 325 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 SSX3Q99909 188 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 KCNK6Q9Y257 313 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ARID1AO14497 2285 aa19.09■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 ALOX5APP20292 161 aa19.08■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 RPS10P46783 165 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 RAB32Q13637 225 aa19.08■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 SLC9A3R2Q15599 337 aa19.08■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 C1QL4Q86Z23 238 aa19.08■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 OR51A2Q8NGJ7 313 aa19.08■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 OR8D1Q8WZ84 308 aa19.08■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 TGM7Q96PF1 710 aa19.08■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 PARPBPQ9NWS1 579 aa19.08■□□□□ 0.65
ODC1-201ENST00000234111 PMP2P02689 132 aa19.08■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 NUDT9Q9BW91 350 aa19.08■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 DNAH14Q0VDD8 3507 aa19.08■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 SOD2P04179 222 aa19.08■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 PCCBP05166 539 aa19.08■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 LYL1P12980 280 aa19.08■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 GAMTQ14353 236 aa19.08■□□□□ 0.64
ODC1-201ENST00000234111 JAGN1Q8N5M9 183 aa19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms