RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 TAS2R4Q9NYW5 299 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 ACOT8O14734 319 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 FCMRO60667 390 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 CSF3P09919 207 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 PHLDA2Q53GA4 152 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 LIPNQ5VXI9 398 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM81Q6P7N7 255 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 NANPQ8TBE9 248 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 SLCO4A1Q96BD0 722 aa18.38■□□□□ 0.53
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CTDP1-208ENST00000613122 ACER3Q9NUN7 267 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf196B1AJZ1 125 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 OR2A2Q6IF42 318 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1958Q8N8K9 716 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 OR1M1Q8NGA1 313 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 OPALINQ96PE5 141 aa18.38■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 SSX4O60224 188 aa18.37■□□□□ 0.53
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CTDP1-208ENST00000613122 TMEM11P17152 192 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 IL11RAQ14626 422 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF573Q86YE8 665 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 S1PR5Q9H228 398 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 HRH4Q9H3N8 390 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 PTTG3PQ9NZH4 202 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 LILRA6Q6PI73 481 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 TRILQ7L0X0 811 aa18.37■□□□□ 0.53
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CTDP1-208ENST00000613122 KCNIP2Q9NS61 270 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 KLK8O60259 260 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 TFAP2EQ6VUC0 442 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF620Q6ZNG0 422 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 PRSS35Q8N3Z0 413 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 CMC2Q9NRP2 79 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 CTSFQ9UBX1 484 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 ASB1Q9Y576 335 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 A0A0D9SG52 128 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa18.37■□□□□ 0.53
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CTDP1-208ENST00000613122 EMDP50402 254 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa18.37■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 FAM173AQ9BQD7 235 aa18.37■□□□□ 0.53
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CTDP1-208ENST00000613122 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 MED29Q9NX70 200 aa18.36■□□□□ 0.53
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CTDP1-208ENST00000613122 ZNF766Q5HY98 468 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 NLRC3Q7RTR2 1065 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 CLEC2DQ9UHP7 191 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
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CTDP1-208ENST00000613122 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 PIPP12273 146 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 FOXF1Q12946 379 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 MDGA2Q7Z553 956 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 REEP6Q96HR9 211 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 SEC22AQ96IW7 307 aa18.36■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
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CTDP1-208ENST00000613122 PLXDC2Q6UX71 529 aa18.35■□□□□ 0.53
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CTDP1-208ENST00000613122 OR5M9Q8NGP3 310 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 TXNIPQ9H3M7 391 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 PRSS37A4D1T9 235 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 ANKUB1A6NFN9 424 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 NXPH3O95157 252 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 NRASP01111 189 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 TLE4Q04727 773 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 LAIR1Q6GTX8 287 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 NUDT9Q9BW91 350 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 PIGAP37287 484 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 SHBQ15464 509 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 ATF6BQ99941 703 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 SLC39A9Q9NUM3 307 aa18.35■□□□□ 0.53
CTDP1-208ENST00000613122 IL9P15248 144 aa18.35■□□□□ 0.53
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