RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 H3BN98 237 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 DSCR3O14972 297 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SH3BGRLO75368 114 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TUSC2O75896 110 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TGFB1P01137 390 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 FPR1P21462 350 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CYB561P49447 251 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 DAPP51397 102 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CDC42P60953 191 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 HBA1P69905 142 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 UBE2V1Q13404 147 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 KEAP1Q14145 624 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 COQ8AQ8NI60 647 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SUSD6Q92537 303 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RORBQ92753 470 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 UBE2E3Q969T4 207 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PERPQ96FX8 193 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PKIBQ9C010 78 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 GPR83Q9NYM4 423 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CKAP5Q14008 2032 aa6.89□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CEP290O15078 2479 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 A0A087WZY1 265 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ANTXRLA6NF34 631 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SLC19A2O60779 497 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 FBXO24O75426 580 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 IL7RP16871 459 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 FGF7P21781 194 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 DRD3P35462 400 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SCN1BQ07699 218 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OPCMLQ14982 345 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 METRNLQ641Q3 311 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RGS11O94810 467 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CFIP05156 583 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CA3P07451 260 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 IGFBP4P22692 258 aa6.88□□□□□ -1.31
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HCG18-244ENST00000602516 TAS2R38P59533 333 aa6.88□□□□□ -1.31
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HCG18-244ENST00000602516 CDK5R2Q13319 367 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 COX19Q49B96 90 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.88□□□□□ -1.31
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HCG18-244ENST00000602516 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.88□□□□□ -1.31
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HCG18-244ENST00000602516 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PXT1Q8NFP0 134 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR4F15Q8NGB8 312 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.88□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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