RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602272.5

FARP1-241, Transcript of FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene FARP1, Length 784 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1-241ENST00000602272 KRT33AO76009 404 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 CCNB2O95067 398 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 NDUFB2O95178 105 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 BCL10O95999 233 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 PGA4P0DJD7 388 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 PGA3P0DJD8 388 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 IL32P24001 234 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 MPGP29372 298 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 CSNK1A1P48729 337 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ACTR3P61158 418 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 TSPAN31Q12999 210 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 CAMK2DQ13557 499 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 TAF11Q15544 211 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 GABRA6Q16445 453 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ACKR1Q16570 336 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 MICAQ29983 383 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ARMC4Q5T2S8 1044 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 C9orf135Q5VTT2 229 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 CARD17Q5XLA6 110 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 C20orf196Q8IYI0 205 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 GPR137CQ8N3F9 429 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 AQP11Q8NBQ7 271 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 OR10G2Q8NGC3 310 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 OR9Q2Q8NGE9 314 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 FANK1Q8TC84 345 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 TMEM54Q969K7 222 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ZNF566Q969W8 418 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 S100PBPQ96BU1 408 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 C14orf79Q96F83 325 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 LRR1Q96L50 414 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 DACH2Q96NX9 599 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 TSPAN32Q96QS1 320 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 MED18Q9BUE0 208 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 KATNB1Q9BVA0 655 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 NDEL1Q9GZM8 345 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 OR52D1Q9H346 318 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 TXNIPQ9H3M7 391 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ARMC1Q9NVT9 282 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.95□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 AP4S1Q9Y587 144 aa5.95□□□□□ -1.46
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FARP1-241ENST00000602272 LRRK2Q5S007 2527 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 CIB4A0PJX0 185 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 OR5H1A6NKK0 313 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 E2F6O75461 281 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 TRMUO75648 421 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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FARP1-241ENST00000602272 IGHG1P01857 330 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 CD14P08571 375 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 FCGR1AP12314 374 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ACADSP16219 412 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 CRYGSP22914 178 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 FASP25445 335 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 RPL4P36578 427 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 IST1P53990 364 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 TIRAPP58753 221 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ERVK-25P63136 954 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 TGFBR3Q03167 851 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 RUNX1T1Q06455 604 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 FHL3Q13643 280 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 TAB1Q15750 504 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 STK11Q15831 433 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ATP6AP1Q15904 470 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ZSCAN26Q16670 478 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 HIST3H3Q16695 136 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 CEACAM16Q2WEN9 425 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 RFX4Q33E94 735 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 MESTQ5EB52 335 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 TIMM23BQ5SRD1 257 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 OR7E24Q6IFN5 339 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 HMBOX1Q6NT76 420 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 MZT2AQ6P582 158 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 SMARCD3Q6STE5 483 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 ZNF620Q6ZNG0 422 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa5.94□□□□□ -1.46
FARP1-241ENST00000602272 FAM122BQ7Z309 247 aa5.94□□□□□ -1.46
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