RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM209A	Q5JX71	171 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	OR5AS1	Q8N127	324 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	RNF148	Q8N7C7	305 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	LZIC	Q8WZA0	190 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF570	Q96NI8	536 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	GAL3ST1	Q99999	423 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	SYT4	Q9H2B2	425 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	MMP26	Q9NRE1	261 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	GPR160	Q9UJ42	338 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		12.53	□□□□□ -0.4
FCHO1-231	ENST00000600201	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	PRSS37	A4D1T9	235 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201		A6NIZ1	184 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	GSTA4	O15217	222 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	PTP4A3	O75365	173 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	ABHD16A	O95870	558 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	FSHB	P01225	129 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	IGHV2-70	P01814	119 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	SELE	P16581	610 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	OMP	P47874	163 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	NUDT2	P50583	147 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	RAP1B	P61224	184 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	RAP1A	P62834	184 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	CDK5R2	Q13319	367 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	ZBED5	Q49AG3	693 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	MTX3	Q5HYI7	312 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM162A	Q96A26	154 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	CMBL	Q96DG6	245 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		12.52	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	PLSCR5	A0PG75	271 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201		H0YL77	283 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	RER1	O15258	196 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	SGCE	O43556	437 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC16A7	O60669	478 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF205	O95201	554 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	CD55	P08174	381 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	ADH4	P08319	380 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	PCMT1	P22061	227 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	HILS1	P60008	231 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	TEK	Q02763	1124 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	FGD3	Q5JSP0	725 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	RAB1C	Q92928	201 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	RAB39B	Q96DA2	213 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	C7orf34	Q96L11	122 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	FUZ	Q9BT04	418 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	FN3K	Q9H479	309 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	NPTN	Q9Y639	398 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		12.51	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A0G2JMP0	313 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A0X1KG70	313 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	GMNC	A6NCL1	334 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	OR6C6	A6NF89	314 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	SLC22A2	O15244	555 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	PPP1R3D	O95685	299 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	MT-ND5	P03915	603 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	SBK2	P0C263	348 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	NR2C1	P13056	603 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	PSME3	P61289	254 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	ZMYND11	Q15326	602 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	CORO6	Q6QEF8	472 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		12.5	□□□□□ -0.41
FCHO1-231	ENST00000600201	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41

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