RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563207.1

USB1-208, Transcript of U6 snRNA biogenesis phosphodiesterase 1, human

TSL 5

Gene USB1, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USB1-208	ENST00000563207	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	SYT9	Q86SS6	491 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	SKA3	Q8IX90	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	RDH12	Q96NR8	316 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	FN3K	Q9H479	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	POLE4	Q9NR33	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		13.56	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207		A0A1W2PPL8	197 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	CD5L	O43866	347 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	SEC14L2	O76054	403 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	CDA	P32320	146 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	CAPZA2	P47755	286 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	CRMP1	Q14194	572 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	SNAPC1	Q16533	368 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	SGCA	Q16586	387 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	GSG1	Q2KHT4	349 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	RERGL	Q9H628	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	DCTN6	O00399	190 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	RAB36	O95755	333 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	PTH	P01270	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	IGLV1-44	P01699	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	CELA3B	P08861	270 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	CD79A	P11912	226 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	RAB1A	P62820	205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	HSF2	Q03933	536 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	RAB35	Q15286	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	TRIP10	Q15642	601 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	TSSK2	Q96PF2	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	SLC29A1	Q99808	456 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	SH3GL3	Q99963	347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	C1orf198	Q9H425	327 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	PRODH	O43272	600 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	HLA-H	P01893	362 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	EPHA2	P29317	976 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	CALCR	P30988	508 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	SLC34A1	Q06495	639 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	RIPK1	Q13546	671 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	C12orf73	Q69YU5	71 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	MDP1	Q86V88	176 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	RNF121	Q9H920	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207	RTTN	Q86VV8	2226 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USB1-208	ENST00000563207		H7C417	338 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	SERPINA5	P05154	406 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	GAA	P10253	952 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	SPI1	P17947	270 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	FMO3	P31513	532 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	CDC42	P60953	191 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	EFNB1	P98172	346 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	PLP2	Q04941	152 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	PIGF	Q07326	219 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	AQP6	Q13520	282 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	ZNF544	Q6NX49	715 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		13.52	□□□□□ -0.25
USB1-208	ENST00000563207	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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