RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	OR6S1	Q8NH40	331 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	FANK1	Q8TC84	345 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	SNX33	Q8WV41	574 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	RASD2	Q96D21	266 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	TIMD4	Q96H15	378 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	ZNF75A	Q96N20	296 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	ZNF347	Q96SE7	839 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	SYT3	Q9BQG1	590 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	FUZ	Q9BT04	418 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	INIP	Q9NRY2	104 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		5.85	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688		A0A0G2JK05	382 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PRQ8	180 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	C17orf100	A8MU93	164 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	PPIAL4D	F5H284	164 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	SOCS2	O14508	198 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	MGRN1	O60291	552 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	KRT36	O76013	467 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	PTH	P01270	115 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	GAST	P01350	101 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	SERPINA5	P05154	406 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	RAD52	P43351	418 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	GSS	P48637	474 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	FXYD6P3	P58550	94 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	CTXN1	P60606	82 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	IL13RA1	P78552	427 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	DEFA6	Q01524	100 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	PIGF	Q07326	219 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	SLC3A1	Q07837	685 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	ZP4	Q12836	540 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	FHL1	Q13642	323 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	DGCR6	Q14129	220 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	OCLN	Q16625	522 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	HFE	Q30201	348 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	SCAI	Q8N9R8	606 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	ASB10	Q8WXI3	467 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	NSMAF	Q92636	917 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	RAB1C	Q92928	201 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	SAMD8	Q96LT4	415 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688		Q96M85	177 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	FOXB1	Q99853	325 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	SLC6A7	Q99884	636 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	C1orf198	Q9H425	327 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	FN3K	Q9H479	309 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	RERGL	Q9H628	205 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	DECR2	Q9NUI1	292 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		5.84	□□□□□ -1.47
CS-233	ENST00000552688	DYSF	O75923	2080 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PRG6	482 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	CLDN25	C9JDP6	229 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688		H3BNX3	289 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	CDC14B	O60729	498 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	FOXH1	O75593	365 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	NCR1	O76036	304 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	SLC2A10	O95528	541 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	SNAP29	O95721	258 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	GPANK1	O95872	356 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	IGHV2-5	P01817	119 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	B4GALT1	P15291	398 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	ZNF250	P15622	560 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	PRTN3	P24158	256 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CS-233	ENST00000552688	POU1F1	P28069	291 aa		5.83	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms