RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CCL2P13500 99 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 PAX1P15863 534 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FPR3P25089 353 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 LAP3P28838 519 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SDHAP31040 664 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 RPS6KA3P51812 740 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 HGFACQ04756 655 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MICAQ29983 383 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 AGAP6Q5VW22 663 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OTPQ5XKR4 325 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FBXL14Q8N1E6 418 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MUC15Q8N387 334 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FANK1Q8TC84 345 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 IFT27Q9BW83 186 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SIAEQ9HAT2 523 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FAIMQ9NVQ4 179 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 VSTM5A8MXK1 200 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OVOL3O00110 214 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SLC16A7O60669 478 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 NDUFS7O75251 213 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FKBP6O75344 327 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ENTPD5O75356 428 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MPZL1O95297 269 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 NR2C1P13056 603 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 NPR2P20594 1047 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 PRKACGP22612 351 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SLC6A6P31641 620 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CENPAP49450 140 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SLC36A2Q495M3 483 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 KRT80Q6KB66 452 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 LINC00471Q8N535 108 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OR4K13Q8NH42 304 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FNDC8Q8TC99 324 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 GIPC3Q8TF64 312 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 NABP1Q96AH0 204 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FBXO17Q96EF6 278 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 TSSK2Q96PF2 358 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 NUAK2Q9H093 628 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SYT4Q9H2B2 425 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 EMC7Q9NPA0 242 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CA10Q9NS85 328 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 E2F6O75461 281 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 TIPRLO75663 272 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SOX14O95416 240 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 GPANK1O95872 356 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 TXNDC12O95881 172 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 SERPINA5P05154 406 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 OR4A8P0C604 315 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ZNF35P13682 527 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 CTLA4P16410 223 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 ZNF32P17041 273 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 THBS4P35443 961 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 HSF2Q03933 536 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 PLP2Q04941 152 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 DAG1Q14118 895 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 MST1LQ2TV78 715 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-217ENST00000550044 FAM27BQ5VT28 67 aa8.3□□□□□ -1.08
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