RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528252.5

SOX6-210, Transcript of SRY-box 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SOX6, Length 2,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6-210ENST00000528252 IL10RAQ13651 578 aa7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 PCOLCEQ15113 449 aa7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SLC6A19Q695T7 634 aa7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 MED12Q93074 2177 aa7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 RFT1Q96AA3 541 aa7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 RASL10BQ96S79 203 aa7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 CMKLR1Q99788 373 aa7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.4□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 PSMD9O00233 223 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 GPR31O00270 319 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 AHSA1O95433 338 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 MT-ATP6P00846 226 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 IFNA4P05014 189 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SMIM6P0DI80 62 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SLC25A1P53007 311 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 CLDN6P56747 220 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 TAS2R43P59537 309 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SGCBQ16585 318 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 GSG1Q2KHT4 349 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 HES5Q5TA89 166 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 OR6V1Q8N148 313 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 KDM8Q8N371 416 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 EXD3Q8N9H8 876 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 ELP5Q8TE02 316 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 GHSRQ92847 366 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 PELI1Q96FA3 418 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SYT4Q9H2B2 425 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 NCDNQ9UBB6 729 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 GNG8Q9UK08 70 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 R4GN57 208 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 TVP23AA6NH52 213 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 FLRT2O43155 660 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 OR6A2O95222 327 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 IGHV2-70P01814 119 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 ZNF883P0CG24 379 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 AVPR2P30518 371 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 RFC3P40938 356 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 TSC22D1Q15714 1073 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 ACKR1Q16570 336 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 EMC4Q5J8M3 183 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SVIPQ8NHG7 77 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 ABHD4Q8TB40 342 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 STK35Q8TDR2 534 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 ST8SIA1Q92185 356 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.39□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 PLSCR5A0PG75 271 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 MASP2O00187 686 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 OR2T1O43869 369 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 ITGA10O75578 1167 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 GPANK1O95872 356 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 RENP00797 406 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 CYC1P08574 325 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 FBXO45P0C2W1 286 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 IL11P20809 199 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SHC1P29353 583 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 PSMB10P40306 273 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 PTGDSP41222 190 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 ACTA2P62736 377 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 ACTG2P63267 376 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SIRPAP78324 504 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 FOXF1Q12946 379 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 SYS1Q8N2H4 156 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 RNF138Q8WVD3 245 aa7.38□□□□□ -1.23
SOX6-210ENST00000528252 THAP4Q8WY91 577 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms