RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516462.1

RNU6-1110P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1110, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1110P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1110P-201ENST00000516462 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 AKNAQ7Z591 1439 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 NACAE9PAV3 2078 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 KANK1Q14678 1352 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 USP47Q96K76 1375 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 MROH7Q68CQ1 1323 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 LRP4O75096 1905 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TRAV39A0A0B4J263 110 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SMCO3A2RU48 225 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CTAGE15A4D2H0 777 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TCP11X1B4DZS4 312 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CDC7O00311 574 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 GABRPO00591 440 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 PLPP1O14494 284 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ZBTB5O15062 677 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SIVA1O15304 175 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RAD51BO15315 384 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 NVLO15381 856 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 AIREO43918 545 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SOX15O60248 233 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 KLHL41O60662 606 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CDH16O75309 829 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 FKBP6O75344 327 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CCNKO75909 580 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 OR2F2O95006 317 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 H6PDO95479 791 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RAB3DO95716 219 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SERPINE2P07093 398 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CD3GP09693 182 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 OR8U9P0C7N5 309 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 LINC00869P0C866 280 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 OR8G3PP0DMU2 310 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 MYL2P10916 166 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CTRB1P17538 263 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TCP1P17987 556 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ATF6P18850 670 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TCN2P20062 427 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 BCKDHBP21953 392 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 LOXP28300 417 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SSTR5P35346 364 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 LONP1P36776 959 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TGFBR1P36897 503 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SYKP43405 635 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 NAMPTP43490 491 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RPS5P46782 204 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 UQCRFS1P47985 274 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RAB7AP51149 207 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 PRRX1P54821 245 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 UGT2B15P54855 530 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CDKN2DP55273 166 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 C21orf59P57076 290 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 HERVK_113P61574 105 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RPS23P62266 143 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RPS15P62841 145 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SEMG2Q02383 582 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CYP24A1Q07973 514 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 LRRC74AQ0VAA2 488 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CDC20Q12834 499 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ERCC8Q13216 396 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ITIH4Q14624 930 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 GINS1Q14691 196 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TRAM2Q15035 370 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RCN1Q15293 331 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 PPP1R7Q15435 360 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SHHQ15465 462 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 OR7A5Q15622 319 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SSX2Q16385 188 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 GABRA6Q16445 453 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ABCA11PQ4W5N1 156 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 GCSAMLQ5JQS6 135 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 C9orf135Q5VTT2 229 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 RAET1LQ5VY80 246 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CARD17Q5XLA6 110 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 C22orf42Q6IC83 251 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 TMEM53Q6P2H8 277 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 ABHD13Q7L211 337 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 SLC16A14Q7RTX9 510 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 CTAGE6Q86UF2 777 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 WDFY1Q8IWB7 410 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 IQCKQ8N0W5 287 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 OSR2Q8N2R0 312 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 BBS5Q8N3I7 341 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1110P-201ENST00000516462 METTL13Q8N6R0 699 aa0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms