RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	CHRM2	P08172	466 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MMP15	P51511	669 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SELENOV	P59797	346 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FAM53B	Q14153	422 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	HNF4G	Q14541	408 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	EMC4	Q5J8M3	183 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MORN4	Q8NDC4	146 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LRFN5	Q96NI6	719 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ABHD6	Q9BV23	337 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LAT2	Q9GZY6	243 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LUZP4	Q9P127	313 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PISD	Q9UG56	409 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GUH1	482 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR5H14	A6NHG9	310 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CD300LB	A8K4G0	201 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SULT1C2	O00338	296 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TXNL1	O43396	289 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	IGHV3-9	P01782	118 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ITGB2	P05107	769 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	S100P	P25815	95 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CAPZB	P47756	277 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1CA	P62136	330 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	COMTD1	Q86VU5	262 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RNF141	Q8WVD5	230 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	C3orf49	Q96BT1	292 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PFDN5	Q99471	154 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	JAM3	Q9BX67	310 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	POMT2	Q9UKY4	750 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	B9D1	Q9UPM9	204 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LGALS8	O00214	317 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GPANK1	O95872	356 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	IFNA1	P01562	189 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	INHBB	P09529	407 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CT62	P0C5K7	136 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PEA15	Q15121	130 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZS52	159 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TMED6	Q8WW62	240 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MARC2	Q969Z3	335 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OR5B12	Q96R08	314 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SBF2	Q86WG5	1849 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PPC4	97 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		H3BUI4	141 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GUSB	P08236	651 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	IL32	P24001	234 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	APLNR	P35414	380 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ALDH3B1	P43353	468 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RFX2	P48378	723 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CLINT1	Q14677	625 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ST3GAL2	Q16842	350 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	CHST11	Q9NPF2	352 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193		V9GYH0	126 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	QDPR	P09417	244 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	RAC2	P15153	192 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	S100A12	P80511	92 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ECH1	Q13011	328 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	IRF3	Q14653	427 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF74	Q16587	644 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	GJC3	Q8NFK1	279 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NEK1-208	ENST00000512193	ST8SIA4	Q92187	359 aa		7.3	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms