RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 GLB1L2Q8IW92 636 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6V1Q8N148 313 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ABHD4Q8TB40 342 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 BCL2L14Q9BZR8 327 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM15Q9C019 465 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 REEP1Q9H902 201 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa16.01■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 C12orf71A8MTZ7 269 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 VSTM5A8MXK1 200 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 BHLHE40O14503 412 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CD5LO43866 347 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TP53P04637 393 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 RAP2AP10114 183 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NR4A2P43354 598 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGEB1P43366 347 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 HTR5AP47898 357 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 PCBD1P61457 104 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 AQP6Q13520 282 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NKPD1Q17RQ9 610 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAL1Q4LDG9 190 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNPRQ8TBG9 265 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A40Q8TBP6 338 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 LRMDAQ9H2I8 198 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D23Q9NUY8 699 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ARMC1Q9NVT9 282 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 LHFPL6Q9Y693 200 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 DHRS12A0PJE2 317 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 RER1O15258 196 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SGCEO43556 437 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 STAMBPO95630 424 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 PSKH1P11801 424 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 RAD52P43351 418 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CENPAP49450 140 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 FLOT2Q14254 428 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIP10Q15642 601 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ELFN2Q5R3F8 820 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CORO6Q6QEF8 472 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 LYPD4Q6UWN0 246 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SYT9Q86SS6 491 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CYB561A3Q8NBI2 242 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52L1Q8NGH7 329 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4Q3Q8NH05 313 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNRF4Q8WWF5 429 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SOX7Q9BT81 388 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CHID1Q9BWS9 393 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2J1Q9GZK6 312 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 B9D1Q9UPM9 204 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR1DQ9Y2S0 133 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFS8O00217 210 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ICMTO60725 284 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 TFP02787 698 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 DBHP09172 617 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 USF1P22415 310 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NOS3P29474 1203 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 MICAQ29983 383 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00346Q8IVM7 164 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 HS3ST5Q8IZT8 346 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NPEPL1Q8NDH3 523 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC26A10Q8NG04 563 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 UBASH3BQ8TF42 649 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 YIPF5Q969M3 257 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX18Q96RF0 628 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEK2Q9NYT0 353 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 POMPQ9Y244 141 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SVEP1Q4LDE5 3571 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 LRP5LA4QPB2 252 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 OR6C6A6NF89 314 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 AQP12BA6NM10 295 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ABHD16AO95870 558 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 RENP00797 406 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CST1P01037 141 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 CRABP1P29762 137 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 IL2RGP31785 369 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP2-218ENST00000511185 PYCR1P32322 319 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms