RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP6V1G2O95670 118 aa11.64□□□□□ -0.55
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PGGT1B-204ENST00000503638 C5orf49A4QMS7 147 aa11.63□□□□□ -0.55
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PGGT1B-204ENST00000503638 KRTAP10-9P60411 292 aa11.61□□□□□ -0.55
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PGGT1B-204ENST00000503638 RAB35Q15286 201 aa11.61□□□□□ -0.55
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC18B1Q6NT16 456 aa11.61□□□□□ -0.55
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PGGT1B-204ENST00000503638 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 DCXRQ7Z4W1 244 aa11.61□□□□□ -0.55
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PGGT1B-204ENST00000503638 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-204ENST00000503638 OR1F12Q8NHA8 337 aa11.61□□□□□ -0.55
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