RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495360.5

APTX-232, Transcript of aprataxin, humanhuman

TSL 5

Gene APTX, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTX-232ENST00000495360 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.73□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.73□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 PYURFQ96I23 114 aa14.73□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.73□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa14.73□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 FAM157AC9JC47 383 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 H3BSA7 217 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 SGCEO43556 437 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 GADD45GO95257 159 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 ABHD16AO95870 558 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 COX5BP10606 129 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 PCMT1P22061 227 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 HTR5AP47898 357 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 RPS6KA3P51812 740 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 SMIM11AP58511 58 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 FXYD6P3P58550 94 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 MVKQ03426 396 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 AQP6Q13520 282 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 FAM209AQ5JX71 171 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 AVPI1Q5T686 147 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 OTPQ5XKR4 325 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 RINLQ6ZS11 566 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 NSMCE2Q96MF7 247 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 FUZQ9BT04 418 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.72□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 CLDN25C9JDP6 229 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 IMPA2O14732 288 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 ARPC2O15144 300 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 SEMG1P04279 462 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 MSMBP08118 114 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 GAAP10253 952 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 HFEQ30201 348 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 NPEPL1Q8NDH3 523 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 FANK1Q8TC84 345 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 ELMOD3Q96FG2 381 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 CDRT15Q96T59 188 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 GPA33Q99795 319 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 CD300AQ9UGN4 299 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 CACNG2Q9Y698 323 aa14.71□□□□□ -0.05
APTX-232ENST00000495360 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.71□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 DCTN3O75935 186 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 MPZL1O95297 269 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 PPP1R3DO95685 299 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 GSTM3P21266 225 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 LIPAP38571 399 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 LMO4P61968 165 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 MXRA7P84157 204 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 PTCHD4Q6ZW05 846 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 OR51F2Q8NH61 342 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 TMEM186Q96B77 213 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 NUAK2Q9H093 628 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 NDE1Q9NXR1 346 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 OR10H3O60404 316 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 TXNDC12O95881 172 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 FABP3P05413 133 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 CENPAP49450 140 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 PSG7Q13046 419 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 DNM1P34Q6PK57 102 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 C16orf89Q6UX73 402 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 ZER1Q7Z7L7 766 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 DEFB107AQ8IZN7 70 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 CCL17Q92583 94 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 TIMD4Q96H15 378 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 DIRC2Q96SL1 478 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 OR52D1Q9H346 318 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 POFUT1Q9H488 388 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 MSL2Q9HCI7 577 aa14.69□□□□□ -0.06
APTX-232ENST00000495360 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms