RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ST3GAL6Q9Y274 331 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 NME4O00746 187 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ZMPSTE24O75844 475 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SERF1AO75920 110 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 HPNP05981 417 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF3P17036 446 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 COX7A1P24310 79 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SHC1P29353 583 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ARR3P36575 388 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC35B1P78383 322 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SEMG2Q02383 582 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF45Q02386 682 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 AQP6Q13520 282 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 GPNMBQ14956 572 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CCNJQ5T5M9 372 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 FHL5Q5TD97 284 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 LCN12Q6JVE5 192 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1N2Q8NGR9 330 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 OR51E1Q8TCB6 317 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM239Q8WW34 195 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 VGLL1Q99990 258 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf198Q9H425 327 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A22Q9H936 323 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 MARCH5Q9NX47 278 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC17A7Q9P2U7 560 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 A6NDN8 102 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 HIDE1A8MVS5 230 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFSF11O14788 317 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 PI15O43692 258 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 UTS2O95399 124 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FADS2O95864 444 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf47O95873 294 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 HPRT1P00492 218 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CSF3P09919 207 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FOLR2P14207 255 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 GGT1P19440 569 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RND2P52198 227 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 APOC4P55056 127 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SKP1P63208 163 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 PMS2P3Q13401 168 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TFDP2Q14188 446 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FZD2Q14332 565 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC1A5Q15758 541 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 DUPD1Q68J44 220 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 METTL7BQ6UX53 244 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM179Q6ZVK1 233 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP41Q8N8Y5 198 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR31Q8NA23 367 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 DNASE2BQ8WZ79 361 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM230Q96A57 120 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SCGB3A2Q96PL1 93 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 AGMATQ9BSE5 352 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 MED10Q9BTT4 135 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 PAXXQ9BUH6 204 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCB10Q9NRK6 738 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 NECAP2Q9NVZ3 263 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 Q9UF83 564 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF580Q9UK33 172 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 GAKO14976 1311 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM166BA8MTA8 275 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 GABRPO00591 440 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB5AP20339 215 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKAR2BP31323 418 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 HRH1P35367 487 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CRATP43155 626 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FABP6P51161 128 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 P2RY4P51582 365 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 PAFAH1B2P68402 229 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CD300LGQ6UXG3 332 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RFLNAQ6ZTI6 216 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SPAG16Q8N0X2 631 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 MREGQ8N565 214 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ARRDC1Q8N5I2 433 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 MDS2Q8NDY4 140 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52E2Q8NGJ4 325 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5AR1Q8NGP9 310 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 GTF2H4Q92759 462 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR21Q99679 349 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 NICN1Q9BSH3 213 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC39A1Q9NY26 324 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms