RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 GPR89AB7ZAQ6 455 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 CCNE2O96020 404 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 APCSP02743 223 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 IGKV4-1P06312 121 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 GPR89BP0CG08 455 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 HNMTP50135 292 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 KCNJ2P63252 427 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 CALHM3Q86XJ0 350 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 TIMM29Q9BSF4 260 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 S4R3C0 116 aa3.31□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 HECW1Q76N89 1606 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 SURF6O75683 361 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 CDRT1O95170 752 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 IL4P05112 153 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 IFNA8P32881 189 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 KIR3DL2P43630 455 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 TWF1Q12792 350 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 CHIT1Q13231 466 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 IRF4Q15306 451 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 METTL21CQ5VZV1 264 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 PDIK1LQ8N165 341 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 MS4A15Q8N5U1 240 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 OR4K5Q8NGD3 323 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 SERPINB12Q96P63 405 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 ING4Q9UNL4 249 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 TMED5Q9Y3A6 229 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 EP400Q96L91 3159 aa3.3□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 CFAP74Q9C0B2 1584 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 FAM135BQ49AJ0 1406 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 A0A0U1RQV1 116 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 YIF1AO95070 293 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 MXD1Q05195 221 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 TGFBIQ15582 683 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 RAET1LQ5VY80 246 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 ZFP41Q8N8Y5 198 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 OR2L3Q8NG85 312 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 FAM49BQ9NUQ9 324 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 PHLPP1O60346 1717 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 MYO3AQ8NEV4 1616 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 ABCA8O94911 1581 aa3.29□□□□□ -1.88
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SGCE-210ENST00000472326 VWDEQ8N2E2 1590 aa3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 DISP1Q96F81 1524 aa3.29□□□□□ -1.88
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SGCE-210ENST00000472326 SERPIND1P05546 499 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 RAB3BP20337 219 aa3.28□□□□□ -1.88
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SGCE-210ENST00000472326 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 ZFP1Q6P2D0 407 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 LINC01560Q8TB33 94 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 PIBF1Q8WXW3 757 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 IKZF2Q9UKS7 526 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 LRP6O75581 1613 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 NHSL1Q5SYE7 1610 aa3.28□□□□□ -1.88
SGCE-210ENST00000472326 SYNMO15061 1565 aa3.28□□□□□ -1.88
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SGCE-210ENST00000472326 ARHGEF35A5YM69 484 aa3.27□□□□□ -1.89
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SGCE-210ENST00000472326 EGFL6Q8IUX8 553 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 GATSQ8NAP1 163 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 SUN2Q9UH99 717 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.27□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 HLA-DQA1P01909 254 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 OR5H8P0DN80 308 aa3.26□□□□□ -1.89
SGCE-210ENST00000472326 CCNB1P14635 433 aa3.26□□□□□ -1.89
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