RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460731.5

PTPN12-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 2

Gene PTPN12, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-209	ENST00000460731	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SOX14	O95416	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CLDN14	O95500	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	QDPR	P09417	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RNF224	P0DH78	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PPP3CB	P16298	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CTLA4	P16410	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NPR2	P20594	1047 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	BMP5	P22003	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CRABP1	P29762	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	UGT2B10	P36537	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ACVR1B	P36896	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CD79B	P40259	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PEX19	P40855	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CSNK1A1	P48729	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ASCL1	P50553	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	HIST1H3A	P68431	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TMED1	Q13445	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	GABRA6	Q16445	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TEX30	Q5JUR7	227 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TTC23	Q5W5X9	447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NIPAL3	Q6P499	406 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CASP12	Q6UXS9	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RASD2	Q96D21	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NMNAT3	Q96T66	252 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SIAE	Q9HAT2	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MOK	Q9UQ07	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	LRRC42	Q9Y546	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731		H3BN98	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731		J3QRE1	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	XKRY	O14609	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PRODH	O43272	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	PRKY	O43930	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MPZL2	O60487	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC2A10	O95528	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	IFNG	P01579	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	TF	P02787	698 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	GAA	P10253	952 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN12-209	ENST00000460731	LAP3	P28838	519 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.8 ms