RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395789.5

C6orf48-209, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene C6orf48, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-209ENST00000395789 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 OR6C6A6NF89 314 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 H3BN98 237 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 H7C417 338 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 SYNGR3O43761 229 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 ICMTO60725 284 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 PTHP01270 115 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 GYPBP06028 91 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 CLUP10909 449 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 POU1F1P28069 291 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 PCSK6P29122 969 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 EPHA2P29317 976 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 ARHGDIAP52565 204 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 ATP5J2P56134 94 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 PCBD1P61457 104 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 PPP2R2BQ00005 443 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 TEKQ02763 1124 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 GLO1Q04760 184 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 PLP2Q04941 152 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 AQP6Q13520 282 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 TMEM236Q5W0B7 351 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 DNM1P46Q6ZS02 220 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 HIPK1Q86Z02 1210 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 ZNF101Q8IZC7 436 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 OR51L1Q8NGJ5 315 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 DNAJC9Q8WXX5 260 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 ZNF556Q9HAH1 456 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 SLC25A19Q9HC21 320 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa11.46□□□□□ -0.57
C6orf48-209ENST00000395789 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 FAM183AA6NL82 134 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 B9A039 149 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 RER1O15258 196 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 SURF4O15260 269 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 SGCEO43556 437 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 FAM157BP0CG42 384 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 COX5BP10606 129 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 ZNF23P17027 643 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 SPI1P17947 270 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 APLNRP35414 380 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 CRISP1P54107 249 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 UCP2P55851 309 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 ERVS71-1P61550 626 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 SCRN3Q0VDG4 424 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 PCK2Q16822 640 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 TMEM255AQ5JRV8 349 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 Q5PR19 223 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 SHEQ5VZ18 495 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 SLC18B1Q6NT16 456 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 ZFP1Q6P2D0 407 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 CORO6Q6QEF8 472 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 LRP11Q86VZ4 500 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 LURAP1LQ8IV03 231 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 OR1J2Q8NGS2 313 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 OR2T4Q8NH00 348 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 MED20Q9H944 212 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 CDH20Q9HBT6 801 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 OAZ3Q9UMX2 235 aa11.45□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 C5orf49A4QMS7 147 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 TVP23AA6NH52 213 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 RIIAD1A6NNX1 92 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 NGFP01138 241 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 IFNGP01579 166 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 ZNF3P17036 446 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 CENPAP49450 140 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 EFNB1P98172 346 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 GALK2Q01415 458 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 CFAP77Q6ZQR2 320 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 LINC00346Q8IVM7 164 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 SVOPLQ8N434 492 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 ZNF511Q8NB15 262 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 OR10S1Q8NGN2 331 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 OR1F12Q8NHA8 337 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 SLC7A6Q92536 515 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 MAP6Q96JE9 813 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 OR51B6Q9H340 312 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 WDR76Q9H967 626 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 S100A14Q9HCY8 104 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 DLL4Q9NR61 685 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 CMAHPQ9Y471 501 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 SPEF1Q9Y4P9 236 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa11.44□□□□□ -0.58
C6orf48-209ENST00000395789 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms