RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376919.3

SSX1-201, Transcript of SSX family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SSX1, Length 1,298 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1-201ENST00000376919 AKR7A3O95154 331 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 RCBTB2O95199 551 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 OR5F1O95221 314 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 NTN1O95631 604 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 TGM6O95932 706 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 FABP3P05413 133 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 SAGP10523 405 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 COX6B1P14854 86 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 AHCYP23526 432 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 DNASE1P24855 282 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 ZNF136P52737 540 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 CDH12P55289 794 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 SPIBQ01892 262 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 CHRNB3Q05901 458 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 C1DQ13901 141 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 FLOT2Q14254 428 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 TRAM2Q15035 370 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 VWC2Q2TAL6 325 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 HFEQ30201 348 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 MTX3Q5HYI7 312 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 CASP12Q6UXS9 341 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 ZNF730Q6ZMV8 503 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 KCTD9Q7L273 389 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 LINGO2Q7L985 606 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 ADCK1Q86TW2 530 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 HAPLN4Q86UW8 402 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 COMTD1Q86VU5 262 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 SPATA24Q86W54 205 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 ADGRG3Q86Y34 549 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 CDK20Q8IZL9 346 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 OR6K3Q8NGY3 331 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 RNF128Q8TEB7 428 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 SNAPC3Q92966 411 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 ASB9Q96DX5 294 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 ARL5BQ96KC2 179 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 SEPHS2Q99611 448 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 BTBD10Q9BSF8 475 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 PCGF1Q9BSM1 259 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 UCK2Q9BZX2 261 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 PIGMQ9H3S5 423 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 COQ10BQ9H8M1 238 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 RNF122Q9H9V4 155 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 C12orf10Q9HB07 376 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 MCCC2Q9HCC0 563 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 CHST11Q9NPF2 352 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 GLRX2Q9NS18 164 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 TAS2R3Q9NYW6 316 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 RHCGQ9UBD6 479 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 RABL2BQ9UNT1 228 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 AURKCQ9UQB9 309 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 MED31Q9Y3C7 131 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 HEATR5AQ86XA9 2040 aa4.96□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 CENPEQ02224 2701 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 A0A087WUJ7 227 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 A0A0B4J293 547 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 C11orf98E9PRG8 122 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 GNGT2O14610 69 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 GPR171O14626 319 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 RNF13O43567 381 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 EFNA2O43921 213 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 CYTIPO60759 359 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 TOXO94900 526 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 GADD45GO95257 159 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 CH25HO95992 272 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 LCKP06239 509 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 CRHP06850 196 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 H1F0P07305 194 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 RNF224P0DH78 156 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 POU2F1P14859 743 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 ZNF43P17038 809 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 ATP6V1B2P21281 511 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 AGTR1P30556 359 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 ERFP50548 548 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 SMIM11AP58511 58 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 FOXF2Q12947 444 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 BNIP1Q12981 228 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 ITGADQ13349 1161 aa4.95□□□□□ -1.62
SSX1-201ENST00000376919 PMS2P3Q13401 168 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms