RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN2O60636 221 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 HPNP05981 417 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 GRNP28799 593 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 MNDAP41218 407 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 DUSP7Q16829 419 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 LCN8Q6JVE9 175 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 M0R135 149 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 ACOT8O14734 319 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZT83 130 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF799Q96GE5 643 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 TBPL2Q6SJ96 375 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 RTL8AQ9BWD3 113 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF774Q6NX45 483 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-201ENST00000348564 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.91□□□□□ -1.78
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