RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 TGM4P49221 684 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 PER3P56645 1201 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 TSTQ16762 297 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 TSPO2Q5TGU0 170 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 LYPD4Q6UWN0 246 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 DPPA2Q7Z7J5 298 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 SYT9Q86SS6 491 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 KLBQ86Z14 1044 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GJC3Q8NFK1 279 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 OR8B4Q96RC9 309 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ABHD6Q9BV23 337 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GNG8Q9UK08 70 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 COPS3Q9UNS2 423 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CENPEQ02224 2701 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CLDN1O95832 211 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 IL2RAP01589 272 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CST2P09228 141 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GALP22466 123 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 DCTDP32321 178 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 TIMP3P35625 211 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 LIPAP38571 399 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 RIDAP52758 137 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 HCCSP53701 268 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 OR12D2P58182 307 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 AQP6Q13520 282 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 FBXW9Q5XUX1 488 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 UBE2J2Q8N2K1 259 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 YIPF7Q8N8F6 280 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 FOXB1Q99853 325 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM38BQ9NVV0 291 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 NDUFB11Q9NX14 153 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ENPP5Q9UJA9 477 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GPRIN2O60269 458 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 MPZL1O95297 269 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GPANK1O95872 356 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 OR8G3PP0DMU2 310 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GABRA5P31644 462 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 NTF4P34130 210 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 SIRPAP78324 504 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 TGFBR3Q03167 851 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CEACAM16Q2WEN9 425 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 PHYHD1Q5SRE7 291 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 RPTNQ6XPR3 784 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF627Q7L945 461 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 DCXRQ7Z4W1 244 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CD163Q86VB7 1156 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 PHC2Q8IXK0 858 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 MS4A15Q8N5U1 240 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ISOC1Q96CN7 298 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 FOXN4Q96NZ1 517 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 DOK1Q99704 481 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 SLC7A10Q9NS82 523 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 MALT1Q9UDY8 824 aa15.87■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 A0A1B0GUH1 482 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ZNHIT1O43257 154 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 PLPP2O43688 288 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 AIREO43918 545 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GABARAPO95166 117 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 SERPINA3P01011 423 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 APOC1P02654 83 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 HLA-DPB1P04440 258 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 H2BFMP0C1H6 154 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CELP19835 753 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 MPGP29372 298 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CDAP32320 146 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CASP6P55212 293 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GUSBP1Q15486 140 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 MEP1BQ16820 701 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 TP53I3Q53FA7 332 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 KLHL24Q6TFL4 600 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 SSX6Q7RTT6 188 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 FJX1Q86VR8 437 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC36Q8IYA8 594 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 RNF133Q8WVZ7 376 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 PELI1Q96FA3 418 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 SSR3Q9UNL2 185 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF835Q9Y2P0 537 aa15.86■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF878C9JN71 531 aa15.85■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 SLC22A1O15245 554 aa15.85■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 OGG1O15527 345 aa15.85■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 COL8A1P27658 744 aa15.85■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 TGFBR2P37173 567 aa15.85■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GRB2P62993 217 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ECH1Q13011 328 aa15.85■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 TAF13Q15543 124 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms