RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 AAED1Q7RTV5 226 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF128Q8TEB7 428 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 THRSPQ92748 146 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 BORCS5Q969J3 196 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM54Q969K7 222 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PGLYRP3Q96LB9 341 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2M2Q96R28 347 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf198Q9H425 327 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 EMC3Q9P0I2 261 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP250Q9BV73 2442 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PCSK5Q92824 1860 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6C65A6NJZ3 312 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF879B4DU55 563 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 DHHO43323 396 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD16AO95870 558 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK2P20151 261 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN18P56856 261 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 SGCAQ16586 387 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf128Q5T292 105 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 FDX2Q6P4F2 183 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 MZT2AQ6P582 158 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf87Q6PH81 154 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM123Q8N131 208 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR137CQ8N3F9 429 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52N5Q8NH56 324 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP19Q96LK0 163 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 NIPAL2Q9H841 368 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CENPMQ9NSP4 180 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF716A6NP11 495 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 TAF4O00268 1085 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 RGS5O15539 181 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRTM2O43300 516 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 SC5DO75845 299 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFPL1O95159 310 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 INHBBP09529 407 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 H2BFMP0C1H6 154 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CPN1P15169 458 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF24P17028 368 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 NPR2P20594 1047 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 DCTDP32321 178 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 OPRL1P41146 370 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 TAF13Q15543 124 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF133Q8WVZ7 376 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM45BQ96B21 275 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ULBP2Q9BZM5 246 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 NELFAQ9H3P2 528 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR32B1ATL7 298 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 PDCD5O14737 125 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT33AO76009 404 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 RAF1P04049 648 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 SRMP19623 302 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms