RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf198Q9H425 327 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ASCL3Q9NQ33 180 aa20.19■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ARGFXA6NJG6 315 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 IFITM5A6NNB3 132 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 CXCL13O43927 109 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 CSNK1A1P48729 337 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 SELENOPP49908 381 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 GFRA1P56159 465 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 SCN1BQ07699 218 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 DEGS2Q6QHC5 323 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 LRRTM1Q86UE6 522 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 SETD6Q8TBK2 473 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRG7Q96K78 797 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 SLITRK2Q9H156 845 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 POLR1DQ9Y2S0 133 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 V9GY05 133 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 RAF1P04049 648 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 CELA3AP09093 270 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.821e-8■■■■■ 30.3
VSTM4-201ENST00000298454 TALDO1P37837 337 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 RIN1Q13671 783 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 GALNT16Q8N428 558 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 DNAAF1Q8NEP3 725 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF671Q8TAW3 534 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 G6PC2Q9NQR9 355 aa20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 MED13Q9UHV7 2174 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 AIPO00170 330 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 DNPH1O43598 174 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 APOA1P02647 267 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 MAS1P04201 325 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF544Q6NX49 715 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM123Q8N131 208 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 OR10D3Q8NH80 312 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 OR2V1Q8NHB1 315 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 LGALS14Q8TCE9 139 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ROBO4Q8WZ75 1007 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM54Q969K7 222 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 OR52A1Q9UKL2 312 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 CLDN12P56749 244 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 NRARPQ7Z6K4 114 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ASH2LQ9UBL3 628 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA2Q9UM82 520 aa20.17■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 NBL1P41271 181 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 RFX2P48378 723 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa20.16■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 FAM166BA8MTA8 275 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 SLC43A1O75387 559 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ASB5Q8WWX0 329 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 TTTY12Q9BZ98 90 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 KCNMB1Q16558 191 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ASPHD2Q6ICH7 369 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 CADM3Q8N126 398 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 LIN7BQ9HAP6 207 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 B4GALT7Q9UBV7 327 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 DHDHQ9UQ10 334 aa20.15■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.14■□□□□ 0.82
VSTM4-201ENST00000298454 RER1O15258 196 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 PRKAR1AP10644 381 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 NTF4P34130 210 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 MAGEA5P43359 124 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 PITPNBP48739 271 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 TRIQKQ629K1 86 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 KCNJ15Q99712 375 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 FAM206AQ9NX38 181 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 PLA2G10O15496 165 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 NKX2-8O15522 239 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 HPNP05981 417 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 SP1P08047 785 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 NR2C1P13056 603 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 MMP16P51512 607 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 ASAH1Q13510 395 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 SGCAQ16586 387 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 C10orf128Q5T292 105 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD1Q96SE0 405 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa20.14■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 OR5H15A6NDH6 313 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF716A6NP11 495 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 HLA-DQB1P01920 261 aa20.13■□□□□ 0.81
VSTM4-201ENST00000298454 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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