RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 PLPP2O43688 288 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 KRT8P05787 483 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 PGA4P0DJD7 388 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 PGA3P0DJD8 388 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SLC2A1P11166 492 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SOX6P35712 828 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SGCAQ16586 387 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 MFSD4AQ8N468 514 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 OR6N1Q8NGY5 312 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SGK3Q96BR1 496 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 RBP7Q96R05 134 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ABCB9Q9NP78 766 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.75□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 PRR14LQ5THK1 2151 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 IGHMP01871 453 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 PATE4P0C8F1 98 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF823P16415 610 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 RORCP51449 518 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ACTA2P62736 377 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ACTG2P63267 376 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A25Q6KCM7 469 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 CREB3L2Q70SY1 520 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 PRSS35Q8N3Z0 413 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF565Q8N9K5 539 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 OR9K2Q8NGE7 335 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SMIM19Q96E16 107 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 RNF32Q9H0A6 362 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 EXO5Q9H790 373 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PNV4 684 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 CLDN25C9JDP6 229 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 RER1O15258 196 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SULT1B1O43704 296 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ABHD16AO95870 558 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 IGHG1P01857 330 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 CRABP1P29762 137 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 GFRA1P56159 465 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 HSF2Q03933 536 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ACSM1Q08AH1 577 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF766Q5HY98 468 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 IDNKQ5T6J7 187 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SLC7A6Q92536 515 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 MFRPQ9BY79 579 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ABCB10Q9NRK6 738 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 DAPK2Q9UIK4 370 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 TRAPPC4Q9Y296 219 aa9.74□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 A6NIZ1 184 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 K7EM74 188 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 GFRA3O60609 400 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 PMS2P2O95744 297 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 TNFSF8P32971 234 aa9.73□□□□□ -0.85
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GGPS1-201ENST00000282841 RAP1AP62834 184 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SLC17A1Q14916 467 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 Q3ZCU0 254 aa9.73□□□□□ -0.85
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GGPS1-201ENST00000282841 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 MDS2Q8NDY4 140 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 DNAAF1Q8NEP3 725 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 NOXO1Q8NFA2 376 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 FNDC9Q8TBE3 224 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SCNM1Q9BWG6 230 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 NOX4Q9NPH5 578 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 EMC9Q9Y3B6 208 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 LRP12Q9Y561 859 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 PIN1P1O15428 100 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 TBX1O43435 398 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 PRKXP51817 358 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 MAP2K6P52564 334 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 WDR38Q5JTN6 314 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 SYS1Q8N2H4 156 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 MROQ9BYG7 248 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 MMP27Q9H306 513 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 LDAHQ9H6V9 325 aa9.73□□□□□ -0.85
GGPS1-201ENST00000282841 OGG1O15527 345 aa9.73□□□□□ -0.85
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