RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT74Q7RTS7 529 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZAR1Q86SH2 424 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 BIVMQ86UB2 503 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5J2Q8NH18 312 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ARSGQ96EG1 525 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PELI1Q96FA3 418 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL15Q96M94 604 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 LMF1Q96S06 567 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ALG12Q9BV10 488 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CUTCQ9NTM9 273 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CTSFQ9UBX1 484 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ETV7Q9Y603 341 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0G2JK05 382 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SHISA3A0PJX4 238 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 E9PI62 339 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BMH7 237 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GABARAPH6UMI1 98 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 AIPO00170 330 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT33AO76009 404 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MT-ATP6P00846 226 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GYPBP06028 91 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NGFRP08138 427 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CELA2AP08217 269 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ANXA3P12429 323 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 IGFBP2P18065 325 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SRMP19623 302 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 THBS2P35442 1172 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MNDAP41218 407 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CAPZA1P52907 286 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 HSF1Q00613 529 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TNK1Q13470 666 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MFSD13AQ14CX5 517 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF74Q16587 644 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 Q499Y3 187 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA1AQ53H76 456 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 BTN2A1Q7KYR7 527 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MISPQ8IVT2 679 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 GHDCQ8N2G8 530 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR56B4Q8NH76 319 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 NSMAFQ92636 917 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 C8orf44Q96CB5 159 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TIMP4Q99727 224 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR76Q9H967 626 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 MARCH7Q9H992 704 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM165Q9HC07 324 aa6.29□□□□□ -1.4
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