RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4D11Q8NGI4 311 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC16Q969W1 377 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT5BQ9H1J7 359 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF19Q9NS68 423 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL21Q9UJP4 597 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV40A0A0B4J280 105 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CD80P33681 288 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CDK5R2Q13319 367 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL9Q6T311 187 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ITLN1Q8WWA0 313 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 C4orf45Q96LM5 186 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMD8Q96LT4 415 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 F5H0A9 414 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYBA1P05813 215 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 NR2C1P13056 603 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 FUT1P19526 365 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 GSTM3P21266 225 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MDH2P40926 338 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PAX8Q06710 450 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PSG7Q13046 419 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF774Q6NX45 483 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 BRICD5Q6PL45 260 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR3DL3Q8N743 410 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PFN4Q8NHR9 129 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC26A7Q8TE54 656 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SMURF2Q9HAU4 748 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 BEX1Q9HBH7 125 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 IL20RAQ9UHF4 553 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 LRCH1Q9Y2L9 728 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP24Q9Y5R2 645 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 GMEB1Q9Y692 573 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 GMNCA6NCL1 334 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CEACAM18A8MTB9 384 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 OR7A10O76100 309 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD16AO95870 558 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 LAP3P28838 519 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 EPGNQ6UW88 154 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf139Q6ZV77 190 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PTOV1Q86YD1 416 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MOSPD2Q8NHP6 518 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 WFDC12Q8WWY7 111 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SGTBQ96EQ0 304 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF426Q9BUY5 554 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa22.98■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GUS0 222 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SURF4O15260 269 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS2P15880 293 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PCBD1P61457 104 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMC4Q5T2S8 1044 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRN1Q6UXK5 716 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4F5Q8NH21 305 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PKP2Q99959 881 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM181BA6NEQ2 426 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 M0QZ24 198 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MT-ND1P03886 318 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CST2P09228 141 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 RAG2P55895 527 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 OCLNQ16625 522 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 AGKQ53H12 422 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM27BQ5VT28 67 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CROCCP2Q86T23 111 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 NPEPL1Q8NDH3 523 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SIGLEC11Q96RL6 698 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS27Q9BQR3 290 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 VWFP04275 2813 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CMYA5Q8N3K9 4069 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PPL8 197 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PLATP00750 562 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 GNB2P62879 340 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 UPRTQ96BW1 309 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 RBP7Q96R05 134 aa22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 TANC2Q9HCD6 1990 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ICMTO60725 284 aa22.94■■□□□ 1.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIAL4GP0DN37 164 aa22.94■■□□□ 1.26
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