RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 COPS3Q9UNS2 423 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 RASD1Q9Y272 281 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLIT2O94813 1529 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 SHANK3Q9BYB0 1731 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRGV2A0A075B6R0 118 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 MYBPHLA2RUH7 354 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 H3BQ85 93 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 LGALS8O00214 317 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 PALMO75781 387 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 PAHP00439 452 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 OXTP01178 125 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CXCL10P02778 98 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CTSLP07711 333 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 THRAP10827 490 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF708P17019 499 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 DRD5P21918 477 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAS1LP35410 378 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAP3K8P41279 467 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR1G1P47890 313 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 TDO2P48775 406 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 TGM4P49221 684 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDK16Q00536 496 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 DMC1Q14565 340 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 LUZP6Q538Z0 58 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 TP53I3Q53FA7 332 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM71F2Q6NXP2 309 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 FAM131AQ6UXB0 335 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CBWD2Q8IUF1 395 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 DHRSXQ8N5I4 330 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF645Q8N7E2 425 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR4M1Q8NGD0 313 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR10J6PQ8NGY7 276 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 OTUB2Q96DC9 234 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 SEH1LQ96EE3 360 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 MED8Q96G25 268 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 MARVELD1Q9BSK0 173 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 DESI2Q9BSY9 194 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CENPOQ9BU64 300 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 EDEM2Q9BV94 578 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 HIGD2AQ9BW72 106 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ACTR8Q9H981 624 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 MTRRQ9UBK8 725 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 IKZF2Q9UKS7 526 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 C22orf24Q9Y442 160 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 U3KQK5 164 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A0B4J2A0 478 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 GPR89AB7ZAQ6 455 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRBOX1C9JBD0 128 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 MGRN1O60291 552 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC19A2O60779 497 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC22A5O76082 557 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 TSPAN13O95857 204 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 APOA4P06727 396 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 GPR89BP0CG08 455 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 RALAP11233 206 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCNB1P14635 433 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAB3BP20337 219 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 IL12AP29459 219 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 RORAP35398 523 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 KRT20P35900 424 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 SERPINB5P36952 375 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 MT4P47944 62 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 HCAR3P49019 387 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 GFERP55789 205 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 HES1Q14469 280 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZSCAN26Q16670 478 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCDC40Q4G0X9 1142 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 THEM4Q5T1C6 240 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 LIN9Q5TKA1 542 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 TPGS2Q68CL5 300 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 TCF23Q7RTU1 214 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 PAGE2Q7Z2X7 111 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDH26Q8IXH8 852 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 METTL13Q8N6R0 699 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 CCDC89Q8N998 374 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 ACOT4Q8N9L9 421 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 DENND6BQ8NEG7 585 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR4K13Q8NH42 304 aa-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms