RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 HLA-DQA2P01906 255 aa28.75■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10H5Q8NGA6 315 aa28.74■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
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CTDNEP1-209ENST00000574205 STOMP27105 288 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 APEX1P27695 318 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35D3Q5M8T2 416 aa28.68■■■□□ 2.18
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