RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALG10Q5BKT4 473 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 OTPQ5XKR4 325 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 NRMQ8IXM6 262 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR51A7Q8NH64 312 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 NABP1Q96AH0 204 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASB9Q96DX5 294 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNBD2Q96M20 576 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 PKP2Q99959 881 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH3GL1Q99961 368 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM15Q9C019 465 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 OCEL1Q9H607 264 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 MED31Q9Y3C7 131 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 CACNG2Q9Y698 323 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNHD1Q96M86 4753 aa6.13□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 ISPDA4D126 451 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 C5orf49A4QMS7 147 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 B4DSR2 109 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSTA4O15217 222 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCF21O43680 179 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNAP29O95721 258 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 TFP02787 698 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 MSMBP08118 114 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 GAAP10253 952 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 STOMP27105 288 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 LAP3P28838 519 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 GCH1P30793 250 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 KDELR2P33947 212 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 WNT5AP41221 380 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAD52P43351 418 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR4P46093 362 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC7A2P52569 658 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 UCP2P55851 309 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTXN1P60606 82 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 LSAMPQ13449 338 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 COQ5Q5HYK3 327 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 THEM4Q5T1C6 240 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 C10orf128Q5T292 105 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 LIPNQ5VXI9 398 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF774Q6NX45 483 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP51Q70EK9 711 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF148Q8N7C7 305 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABHD4Q8TB40 342 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF519Q8TB69 540 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM186Q96B77 213 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRRC1Q96M27 445 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEPHS2Q99611 448 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1orf198Q9H425 327 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 RERGLQ9H628 205 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 EMC7Q9NPA0 242 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 DECR2Q9NUI1 292 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 GID8Q9NWU2 228 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 CMTM6Q9NX76 183 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.12□□□□□ -1.43
CCNDBP1-212ENST00000567690 AP4S1Q9Y587 144 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms