RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	HIST3H3	Q16695	136 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	THEM4	Q5T1C6	240 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	SSX8	Q7RTT4	187 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	CBR4	Q8N4T8	237 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312		Q8TCH9	128 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	BOD1	Q96IK1	185 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF570	Q96NI8	536 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	RDH12	Q96NR8	316 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	GLTP	Q9NZD2	209 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NUMB-231	ENST00000559312	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2QL1	A1L167	161 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	PRSS37	A4D1T9	235 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	C16orf97	H3BN30	126 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	SOX14	O95416	240 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	HMGN1	P05114	100 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	PPP3CB	P16298	524 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	EDNRA	P25101	427 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	UGT2B10	P36537	528 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	MTNR1B	P49286	362 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	CRISP1	P54107	249 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	CDK5	Q00535	292 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	MYBPC1	Q00872	1141 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	SLC34A1	Q06495	639 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	CD47	Q08722	323 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	NPRL3	Q12980	569 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	CDSN	Q15517	529 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	TRIP10	Q15642	601 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	NRN1L	Q496H8	165 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	MEST	Q5EB52	335 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	CARD17	Q5XLA6	110 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF627	Q7L945	461 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM54	Q969K7	222 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312		Q96M85	177 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	RBP7	Q96R05	134 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	VCX	Q9H320	206 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	CRLF2	Q9HC73	371 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	CMC2	Q9NRP2	79 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312		M0R3G1	203 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	SOCS2	O14508	198 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	ARHGEF9	O43307	516 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM127	O75204	238 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	UPK3A	O75631	287 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	IFNG	P01579	166 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV3-9	P01782	118 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	ITGA5	P08648	1049 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	QDPR	P09417	244 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	RNF224	P0DH78	156 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF3	P17036	446 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	IGFBP2	P18065	325 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV1-2	P23083	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	PAX7	P23759	505 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NUMB-231	ENST00000559312	POU1F1	P28069	291 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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