RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558639.5

PSMA4-208, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 3

Gene PSMA4, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	EPYC	Q99645	322 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	PSD2	Q9BQI7	771 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	C12orf10	Q9HB07	376 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	AURKC	Q9UQB9	309 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		6.57	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	USF3	Q68DE3	2245 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	RNF212B	A8MTL3	300 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639		M0R1B8	84 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	OVOL3	O00110	214 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	GPRIN2	O60269	458 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	RAD51D	O75771	328 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	IGHV4-39	P01824	125 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	OPN1SW	P03999	348 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	NCK1	P16333	377 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	IGHV1-2	P23083	117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CXCR1	P25024	350 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	RRM2	P31350	389 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC1A3	P43003	542 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	OR3A2	P47893	321 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF83	P51522	516 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ACTR3	P61158	418 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	MERTK	Q12866	999 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	EPS8	Q12929	822 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SELENBP1	Q13228	472 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SKP2	Q13309	424 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	RAB35	Q15286	201 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	NPTX1	Q15818	432 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ETFDH	Q16134	617 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	NRF1	Q16656	503 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	PGGHG	Q32M88	737 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ULK3	Q6PHR2	472 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC22A25	Q6T423	547 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	DEF8	Q6ZN54	512 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639		Q6ZT83	130 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	GRINA	Q7Z429	371 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639		Q8N1X5	172 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	HTRA1	Q92743	480 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TAMM41	Q96BW9	452 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF524	Q96C55	264 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	DDIT4L	Q96D03	193 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	PRRC1	Q96M27	445 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	MCHR1	Q99705	422 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ASB6	Q9NWX5	421 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	AP4S1	Q9Y587	144 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	AKAP9	Q99996	3911 aa		6.56	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	ACOT8	O14734	319 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CHP2	O43745	196 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CYTIP	O60759	359 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	E2F6	O75461	281 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	OR5F1	O95221	314 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CST1	P01037	141 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	EDNRA	P25101	427 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	FAS	P25445	335 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TTK	P33981	857 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	FABP6	P51161	128 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	NUDT6	P53370	316 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CDH11	P55287	796 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	OR2B6	P58173	313 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	FHL2	Q14192	279 aa		6.55	□□□□□ -1.36
PSMA4-208	ENST00000558639	TRAM2	Q15035	370 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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