RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 C1orf210Q8IVY1 113 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 GAB3Q8WWW8 586 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 ASB13Q8WXK3 278 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 NMNAT3Q96T66 252 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 MEIOCA2RUB1 952 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 SULT1C4O75897 302 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TBXA2RP21731 343 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 DUSP1P28562 367 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 SRP9P49458 86 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 MEP1BQ16820 701 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 STEAP1BQ6NZ63 245 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM207Q6UWW9 146 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 FBXL14Q8N1E6 418 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 SCCPDHQ8NBX0 429 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TERB2Q8NHR7 220 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 REEP6Q96HR9 211 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 FGF22Q9HCT0 170 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 MEIS3P1A6NDR6 274 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 CLN5O75503 358 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 CLDN1O95832 211 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 HLA-HP01893 362 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 MT-ND4P03905 459 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 F2RP25116 425 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 ITGB8P26012 769 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 CD82P27701 267 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 EDDM3BP56851 147 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 CCL7P80098 99 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 MYBPHQ13203 477 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 PLA1AQ53H76 456 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 XKR7Q5GH72 579 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 GFRALQ6UXV0 394 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 PELI3Q8N2H9 469 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 LFNGQ8NES3 379 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 HSD17B8Q92506 261 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 FRZBQ92765 325 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 PPT2Q9UMR5 302 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 POM121BA6NF01 834 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGAP33O14559 1287 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 CSO75390 466 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 QDPRP09417 244 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 SLC6A12P48065 614 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 DEFB109BQ30KR1 87 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 AGBL4Q5VU57 503 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 DESI1Q6ICB0 168 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZRG5 221 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1W2PR48 441 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TNFSF11O14788 317 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 AKR7A3O95154 331 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 PAPLNO95428 1278 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TFPTP0C1Z6 253 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 T-ENOLP0DO92 83 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 CSN1S1P47710 185 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 BAXQ07812 192 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 Q6ZSR9 355 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 CA13Q8N1Q1 262 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 S1PR3Q99500 378 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 UBQLN3Q9H347 655 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 GNB4Q9HAV0 340 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 RNF150Q9ULK6 438 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TET1Q8NFU7 2136 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TRAV17A0A0B4J275 112 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM129A0AVI4 362 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 SLC22A20A6NK97 555 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFB7P17568 137 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 TNFSF8P32971 234 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 CRMP1Q14194 572 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 ELP2Q6IA86 826 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 USP51Q70EK9 711 aa5.85□□□□□ -1.47
PDE4D-226ENST00000546160 SSX8Q7RTT4 187 aa5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms