RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	AHSA2	Q719I0	299 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	HTRA1	Q92743	480 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	NABP1	Q96AH0	204 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TBX5	Q99593	518 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SH3GL3	Q99963	347 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	COPS4	Q9BT78	406 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MARCH7	Q9H992	704 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	KALRN	O60229	2985 aa		10.43	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	DAPL1	A0PJW8	107 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	PTGES3L	E9PB15	166 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TNFAIP8	O95379	198 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TF	P02787	698 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	LYN	P07948	512 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	PLA2G2A	P14555	144 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	PPP3CB	P16298	524 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	PAX7	P23759	505 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ARR3	P36575	388 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CHN2	P52757	468 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	GABARAPL2	P60520	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	PLP2	Q04941	152 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	FAM27E3	Q08E93	113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TAF13	Q15543	124 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	GABRA6	Q16445	453 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	GSG1	Q2KHT4	349 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF627	Q7L945	461 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SSX8	Q7RTT4	187 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SYT9	Q86SS6	491 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TIGD4	Q8IY51	512 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	GJC3	Q8NFK1	279 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	THEM6	Q8WUY1	208 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	LGALS12	Q96DT0	336 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM80	Q96HE8	168 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	OR10A4	Q9H209	315 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	C1orf198	Q9H425	327 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	OR5H1	A6NKK0	313 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	MYL12B	O14950	172 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	RGS10	O43665	173 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	DOK2	O60496	412 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	OR2T7	P0C7T2	308 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CRHBP	P24387	322 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	DCK	P27707	260 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	UGT2B10	P36537	528 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	PEX19	P40855	299 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ST3GAL4	Q11206	333 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TEX30	Q5JUR7	227 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	OTP	Q5XKR4	325 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	CDC20B	Q86Y33	519 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	SKA3	Q8IX90	412 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	OR2T27	Q8NH04	317 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	OR52N5	Q8NH56	324 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	OTOS	Q8NHW6	89 aa		10.41	□□□□□ -0.74
DDB1-223	ENST00000543658	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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