RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 CYBRD1Q53TN4 286 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 OR51A7Q8NH64 312 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ST7LQ8TDW4 575 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 C10orf82Q8WW14 230 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 C4orf45Q96LM5 186 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF583Q96ND8 569 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ALG12Q9BV10 488 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 EMC7Q9NPA0 242 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 MMP26Q9NRE1 261 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 EGFL7Q9UHF1 273 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 KLHL21Q9UJP4 597 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 HIF3AQ9Y2N7 669 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 FSHBP01225 129 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 IGF2P01344 180 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 UBA52P62987 128 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PSG7Q13046 419 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 OTPQ5XKR4 325 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 LRRC75AQ8NAA5 344 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 BPIFA2Q96DR5 249 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CYSLTR2Q9NS75 346 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 A4GNTQ9UNA3 340 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 NPTNQ9Y639 398 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 MRASO14807 208 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC3A1Q07837 685 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 OR8J3Q8NGG0 315 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 SGMS2Q8NHU3 365 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 SH3GL1Q99961 368 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 MGAM2Q2M2H8 2515 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 NPIPB13A6NJU9 1138 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 NPIPB4C9JG80 1138 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 J3KTA2 159 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 IGHV2-70P01814 119 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 GATA3P23771 443 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 FPR2P25090 351 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGDIAP52565 204 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 MTX3Q5HYI7 312 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 TREML1Q86YW5 311 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ELOVL3Q9HB03 270 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 GMNCA6NCL1 334 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 TRAPPC2LH3BP13 241 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ABHD16AO95870 558 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 IFNA14P01570 189 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 IGHMP01871 453 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 CD55P08174 381 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ADH4P08319 380 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 THRBP10828 461 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 NR2C1P13056 603 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 KDELR2P33947 212 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 LIPAP38571 399 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 PCBD1P61457 104 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ST3GAL3Q11203 375 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ERICH5Q6P6B1 374 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 Q6ZR03 302 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 NRMQ8IXM6 262 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 DEFB108BQ8NET1 73 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 OR2Z1Q8NG97 314 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 OR13C2Q8NGS9 318 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM106BQ9NUM4 274 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF69Q9UC07 566 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRJ-205ENST00000527952 LOC100653049A0A140TA62 436 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 FOXH1O75593 365 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT34O76011 436 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 MSR1P21757 451 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 ERFP50548 548 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 KLF10Q13118 480 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 CDK5R2Q13319 367 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 FHL1Q13642 323 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 C1orf94Q6P1W5 598 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 VTCN1Q7Z7D3 282 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC7A6Q92536 515 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 PRRC1Q96M27 445 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 POLE4Q9NR33 117 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 KCNAB3O43448 404 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 HTR5AP47898 357 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 ARMCX4Q5H9R4 360 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRJ-205ENST00000527952 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.1 ms