RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517230.1

RNA5SP47-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 47, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP47, Length 109 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP47-201ENST00000517230 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 HSF2Q03933 536 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 KLRC3Q07444 240 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 PJVKQ0ZLH3 352 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 AP1B1Q10567 949 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 RPA4Q13156 261 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ILKQ13418 452 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CHRNA6Q15825 494 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SP6Q3SY56 376 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 PDZD11Q5EBL8 140 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 THEM4Q5T1C6 240 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CCNJQ5T5M9 372 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 LIN9Q5TKA1 542 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZFAND6Q6FIF0 208 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ETFRF1Q6IPR1 90 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 FAM71F2Q6NXP2 309 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TRIM40Q6P9F5 258 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 DEGS2Q6QHC5 323 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ENPP6Q6UWR7 440 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 PAGE2Q7Z2X7 111 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 PEX26Q7Z412 305 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CCDC91Q7Z6B0 441 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ANKRD23Q86SG2 305 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CCDC50Q8IVM0 306 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SLC38A6Q8IZM9 456 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CLDN19Q8N6F1 224 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZNF645Q8N7E2 425 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZFP41Q8N8Y5 198 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 DNAAF3Q8N9W5 541 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 FAM71CQ8NEG0 241 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 OR2Z1Q8NG97 314 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 OR10T2Q8NGX3 314 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 OR2G2Q8NGZ5 317 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 OR4K13Q8NH42 304 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SLC2A14Q8TDB8 520 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 LRRC29Q8WV35 223 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TMEM54Q969K7 222 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 NTAN1Q96AB6 310 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CXorf40BQ96DE9 158 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ERP27Q96DN0 273 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CNDP1Q96KN2 507 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 MS4A4EQ96PG1 132 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 OR2V2Q96R30 315 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SH3GL3Q99963 347 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TCHPQ9BT92 498 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ACAT2Q9BWD1 397 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZNF286AQ9HBT8 521 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 KCNJ16Q9NPI9 418 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZNF302Q9NR11 478 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CYP39A1Q9NYL5 469 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 DDX19BQ9UMR2 479 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 B9D1Q9UPM9 204 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 AURKCQ9UQB9 309 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CHMP2BQ9UQN3 213 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TMED5Q9Y3A6 229 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 KDRP35968 1356 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ANKRD12Q6UB98 2062 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TRAV39A0A0B4J263 110 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 A0A1W2PNV4 684 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 SIGLEC16A6NMB1 481 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CTAGE5O15320 804 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZNF208O43345 1280 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 OR7C2O60412 319 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 FMO6PO60774 539 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 TM7SF2O76062 418 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ERLIN2O94905 339 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 S1PR2O95136 353 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 FSTL3O95633 263 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 PAHP00439 452 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 MT-ATP6P00846 226 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 IGHV3-11P01762 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 IGHG4P01861 327 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CRYGBP07316 175 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CCNB1P14635 433 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ZNF708P17019 499 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 RAB3AP20336 220 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 DRD5P21918 477 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 MMP11P24347 488 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ATP5DP30049 168 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 ADRA1AP35348 466 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 MAGEA3P43357 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 OR1G1P47890 313 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 QARSP47897 775 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 LGALS7P47929 136 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNA5SP47-201ENST00000517230 CCL23P55773 120 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms