RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516184.1

RNA5SP227-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 227, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP227, Length 113 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP227-201ENST00000516184 HSD17B6O14756 317 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 ZBTB5O15062 677 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 CHADO15335 359 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 CHST10O43529 356 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 OR7C2O60412 319 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 TOM1O60784 492 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 KERAO60938 352 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 VPS26AO75436 327 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 CTAG2O75638 210 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 SURF6O75683 361 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 KRT34O76011 436 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 OR4F21O95013 312 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 SCELO95171 688 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 LRATO95237 230 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 UTS2O95399 124 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 H6PDO95479 791 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 C1orf105O95561 183 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 DIRAS3O95661 229 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 TSPAN13O95857 204 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 NDUFB10O96000 172 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 TGFAP01135 160 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 IGKV1-39P01597 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 IGLV3-25P01717 112 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 IGHV2-5P01817 119 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 HLA-DQB1P01920 261 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 MT-ND3P03897 115 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 IGLV7-43P04211 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 IGKV1D-39P04432 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 FABP3P05413 133 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 HEXBP07686 556 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 IQCF3P0C7M6 154 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 OR8U9P0C7N5 309 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 SLC35G6P0C7Q6 338 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 ZNF806P0C7X5 589 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 ETS1P14921 441 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 CBR1P16152 277 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 GABRG2P18507 467 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 RAB3BP20337 219 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 DNAJB1P25685 340 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 HSPA1LP34931 641 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 SERPINB5P36952 375 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 VHLP40337 213 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 NBL1P41271 181 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 GRIA1P42261 906 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 EPS15P42566 896 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 CDKN1BP46527 198 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 GALR1P47211 349 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 GSSP48637 474 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 SERPINB8P50452 374 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 ZNF83P51522 516 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 RND2P52198 227 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 ATP1B3P54709 279 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 SYNJ2BPP57105 145 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 SLC26A5P58743 744 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 PPP1CBP62140 327 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 IRF8Q02556 426 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 LIPEQ05469 1076 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 SCRN3Q0VDG4 424 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 ST3GAL4Q11206 333 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 PDK1Q15118 436 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 SS18Q15532 418 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 CCL15Q16663 113 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 DUSP7Q16829 419 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 ZNF181Q2M3W8 571 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 ORMDL2Q53FV1 153 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 XKR7Q5GH72 579 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 GCSAMLQ5JQS6 135 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 LDLRAP1Q5SW96 308 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 CPTPQ5TA50 214 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 ANKRD22Q5VYY1 191 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 OR6B2Q6IFH4 312 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 TRIM40Q6P9F5 258 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 TBPL2Q6SJ96 375 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 TMPPEQ6ZT21 453 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 RABEPKQ7Z6M1 372 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 DHDDSQ86SQ9 333 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 MARCH3Q86UD3 253 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 NUDCD3Q8IVD9 361 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 CCDC50Q8IVM0 306 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 MISPQ8IVT2 679 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 VSTM4Q8IW00 320 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 SLC35F2Q8IXU6 374 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 PRSS58Q8IYP2 241 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 CCDC170Q8IYT3 715 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 FAM9BQ8IZU0 186 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 TMEM123Q8N131 208 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNA5SP227-201ENST00000516184 TMEM256Q8N2U0 113 aa-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.9 ms