RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.35□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 MRGBPQ9NV56 204 aa14.35□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 GID8Q9NWU2 228 aa14.35□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 RHCGQ9UBD6 479 aa14.35□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 SNX13Q9Y5W8 968 aa14.35□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 ISPDA4D126 451 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 J3QLI3 93 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 LIPAP38571 399 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 PCBD1P61457 104 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 FHL1Q13642 323 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 DCAF12L2Q5VW00 463 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 USP43Q70EL4 1123 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 C4orf45Q96LM5 186 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 MSL2Q9HCI7 577 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.34□□□□□ -0.11
HERC3-211ENST00000513325 A6NIZ1 184 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 H7C1C5 153 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 TRIM77I1YAP6 450 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 J3KTA2 159 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 ICMTO60725 284 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 SCG5P05408 212 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 ADH4P08319 380 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 MSR1P21757 451 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 RAP1BP61224 184 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 LCN6P62502 163 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 RAP1AP62834 184 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 PRKCDQ05655 676 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 SLC3A1Q07837 685 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 CGB2Q6NT52 195 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 OAFQ86UD1 273 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 OR13C2Q8NGS9 318 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 LZICQ8WZA0 190 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 C7orf69Q9H7B7 122 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 EMC7Q9NPA0 242 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 UBAP1Q9NZ09 502 aa14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.33□□□□□ -0.12
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HERC3-211ENST00000513325 LCN2P80188 198 aa14.32□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 PSG7Q13046 419 aa14.32□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 TRAM2Q15035 370 aa14.32□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 ANKDD1AQ495B1 522 aa14.32□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 NANPQ8TBE9 248 aa14.32□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 JMJD8Q96S16 334 aa14.32□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 DIRC2Q96SL1 478 aa14.32□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 SLC6A7Q99884 636 aa14.32□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 POLE4Q9NR33 117 aa14.32□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 CMTM6Q9NX76 183 aa14.32□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 TMEM89A2RUT3 159 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 SASH3O75995 380 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 ABHD16AO95870 558 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 CD55P08174 381 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 RBMXP38159 391 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 SLC9A3P48764 834 aa14.31□□□□□ -0.12
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HERC3-211ENST00000513325 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 MTX3Q5HYI7 312 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 TBPL2Q6SJ96 375 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 ARL9Q6T311 187 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 ZNF730Q6ZMV8 503 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 SYT9Q86SS6 491 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 RCN3Q96D15 328 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 POFUT1Q9H488 388 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 DCAF16Q9NXF7 216 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 OPN4Q9UHM6 478 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.31□□□□□ -0.12
HERC3-211ENST00000513325 A0A087WUU8 490 aa14.3□□□□□ -0.12
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