RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 NUAK2Q9H093 628 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 RERGLQ9H628 205 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 B9D1Q9UPM9 204 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 LAMP3Q9UQV4 416 aa9.93□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 SLC22A31A6NKX4 558 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF587BE7ETH6 402 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 H7C1C5 153 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 M0R129 80 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 DHHO43323 396 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 UPK3AO75631 287 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 SPI1P17947 270 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 GABRB1P18505 474 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 IL32P24001 234 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 LCN6P62502 163 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 GLO1Q04760 184 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 STK11Q15831 433 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL12Q53G59 568 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 AADACL4Q5VUY2 407 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 LRFN4Q6PJG9 635 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ZBTB46Q86UZ6 589 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 OR6V1Q8N148 313 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 MCHR2Q969V1 340 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 MDFIQ99750 246 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 RACGAP1Q9H0H5 632 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 OR10A4Q9H209 315 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 RNF115Q9Y4L5 304 aa9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ENTPD6O75354 484 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 GLCEO94923 617 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 PAX1P15863 534 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 FMO3P31513 532 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CDH11P55287 796 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CXCR4P61073 352 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TGFBR3Q03167 851 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 FAPQ12884 760 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TNK1Q13470 666 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 APOFQ13790 326 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TAB1Q15750 504 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 C10orf128Q5T292 105 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TFAP2EQ6VUC0 442 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 WDFY1Q8IWB7 410 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 NSMAFQ92636 917 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TSSK2Q96PF2 358 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TEAD3Q99594 435 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 MED20Q9H944 212 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CRLF2Q9HC73 371 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 GPR35Q9HC97 309 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 NGBQ9NPG2 151 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 SCN3BQ9NY72 215 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 MALT1Q9UDY8 824 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 LRCH1Q9Y2L9 728 aa9.91□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 IRGMA1A4Y4 181 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 RNF223E7ERA6 249 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 TMCC2O75069 709 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV3-9P01782 118 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 HLA-DQA2P01906 255 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 GYPBP06028 91 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CD3EP07766 207 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 CTLA4P16410 223 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 NPR2P20594 1047 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 LAP3P28838 519 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 MPGP29372 298 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 HTR1FP30939 366 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 PYCR1P32322 319 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 ATP6V1E1P36543 226 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 HSF2Q03933 536 aa9.9□□□□□ -0.82
UBE2B-208ENST00000511807 FMODQ06828 376 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms