RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM186	Q96B77	213 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618		Q96M85	177 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	TCF21	O43680	179 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	CCDC22	O60826	627 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	MT-ND5	P03915	603 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	MSMB	P08118	114 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ITGA2	P17301	1181 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	MSR1	P21757	451 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	CRYBB2	P43320	205 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ZBED5	Q49AG3	693 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	SPRN	Q5BIV9	151 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	MEST	Q5EB52	335 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	POFUT1	Q9H488	388 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	POLE4	Q9NR33	117 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ATG4B-223	ENST00000493618	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		12.46	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	IMPA2	O14732	288 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	PCMT1	P22061	227 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	MMP15	P51511	669 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	PSME3	P61289	254 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	PCBD1	P61457	104 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	TEK	Q02763	1124 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	MOG	Q16653	247 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	LIPN	Q5VXI9	398 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	RRM2B	Q7LG56	351 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	OR51F2	Q8NH61	342 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	FNDC8	Q8TC99	324 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	RASD2	Q96D21	266 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	C4orf45	Q96LM5	186 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF570	Q96NI8	536 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	OCEL1	Q9H607	264 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	RERGL	Q9H628	205 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	METRN	Q9UJH8	293 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618		V9GYQ6	96 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	PLSCR5	A0PG75	271 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	CLDN25	C9JDP6	229 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	XKRY	O14609	159 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	DIRAS1	O95057	198 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	MPZL1	O95297	269 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	CD14	P08571	375 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	HFE	Q30201	348 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	FGD3	Q5JSP0	725 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	RNF148	Q8N7C7	305 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	CCL17	Q92583	94 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	MSL2	Q9HCI7	577 aa		12.44	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	PRSS37	A4D1T9	235 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	SOCS2	O14508	198 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	DOK2	O60496	412 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	ABHD16A	O95870	558 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	CTLA4	P16410	223 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	HTR5A	P47898	357 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	ARHGDIA	P52565	204 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	SEC23B	Q15437	767 aa		12.43	□□□□□ -0.42
ATG4B-223	ENST00000493618	GLYAT	Q6IB77	296 aa		12.43	□□□□□ -0.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms