RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 PRSS44E7EML9 344 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 SGCEO43556 437 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ENTPD6O75354 484 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 GYPBP06028 91 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 HSD11B1P28845 292 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 NTF4P34130 210 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ISL1P61371 349 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ACTA2P62736 377 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 RAB1AP62820 205 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ACTG2P63267 376 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 EFNB1P98172 346 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 GALK2Q01415 458 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 CDK5R2Q13319 367 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 GGTLC2Q14390 218 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 TBC1D28Q2M2D7 210 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 TEX30Q5JUR7 227 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 AADACL4Q5VUY2 407 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 OR51L1Q8NGJ5 315 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 FAM222BQ8WU58 562 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 SNX33Q8WV41 574 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 S100PBPQ96BU1 408 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 RNFT2Q96EX2 444 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 RADILQ96JH8 1075 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 DACH2Q96NX9 599 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 TSSK2Q96PF2 358 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 NIPAL2Q9H841 368 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 MED20Q9H944 212 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 METRNQ9UJH8 293 aa8.55□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 OR6C6A6NF89 314 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 WIPF3A6NGB9 483 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF878C9JN71 531 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 DLGAP1O14490 977 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF254O75437 659 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 CRYAAP02489 173 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 KRT8P05787 483 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 LYNP07948 512 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC159P0C7I6 412 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 COX5BP10606 129 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 CBR1P16152 277 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 PTAFRP25105 342 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 DCKP27707 260 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 CDAP32320 146 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ETFDHQ16134 617 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 USP51Q70EK9 711 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 KRT77Q7Z794 578 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF786Q8N393 782 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ACBD7Q8N6N7 88 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 OR10H4Q8NGA5 316 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 OR52N5Q8NH56 324 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 THEM6Q8WUY1 208 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM80Q96HE8 168 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 DDOQ99489 341 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 SH3GL3Q99963 347 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF416Q9BWM5 594 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 CDH20Q9HBT6 801 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 EDARQ9UNE0 448 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CTPS1-210ENST00000486889 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms