RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 SERHL2Q9H4I8 314 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 ISYNA1Q9NPH2 558 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 NDUFAF4Q9P032 175 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 DSPPQ9NZW4 1301 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 ZAR1LA6NP61 321 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 STX11O75558 287 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 DBTP11182 482 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 CBLP22681 906 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 HLA-DMAP28067 261 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 EPHA2P29317 976 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 SRP14P37108 136 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 PRPS1P60891 318 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 TGFBR3Q03167 851 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 RGNQ15493 299 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 MAPK14Q16539 360 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 HIKESHIQ53FT3 197 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 TSPO2Q5TGU0 170 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 KLHL24Q6TFL4 600 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 SNX29P2Q8IUI4 249 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 NATD1Q8N6N6 113 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 MGLLQ99685 303 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF556Q9HAH1 456 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC25A19Q9HC21 320 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 hCG_2039718K7EN88 272 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 DNPH1O43598 174 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 WNT11O96014 354 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 IL1AP01583 271 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 HLA-DQB1P01920 261 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 RRM2P31350 389 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 SERPINF1P36955 418 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 CRYBA2P53672 197 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 HBA1P69905 142 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 SCN1BQ07699 218 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 ST3GAL4Q11206 333 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 BHLHB9Q6PI77 547 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 C12orf54Q6X4T0 127 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 C16orf62Q7Z3J2 963 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 GRINAQ7Z429 371 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 HMGN2P46Q86SG4 172 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 ADGRG3Q86Y34 549 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 TCTE3Q8IZS6 198 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 RDH10Q8IZV5 341 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 CAPSLQ8WWF8 208 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 ST6GAL2Q96JF0 529 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC35G5Q96KT7 338 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 CEP19Q96LK0 163 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 FEVQ99581 238 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 KCNS3Q9BQ31 491 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 DUSP26Q9BV47 211 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 SMURF1Q9HCE7 757 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 POLE4Q9NR33 117 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 PARPBPQ9NWS1 579 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 CLN6Q9NWW5 311 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 KLHL21Q9UJP4 597 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-207ENST00000484547 DUXAA6NLW8 204 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 AK1P00568 194 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 PTHP01270 115 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 RHCEP18577 417 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 CFPP27918 469 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 MPGP29372 298 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 IL2RGP31785 369 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 TNFSF8P32971 234 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 GRK5P34947 590 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 RORCP51449 518 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ARPC4P59998 168 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 H3F3AP84243 136 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 IKZF1Q13422 519 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 RIN1Q13671 783 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 DUSP7Q16829 419 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ZFP69Q49AA0 526 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ATAD3CQ5T2N8 411 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 VHLLQ6RSH7 139 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 C6orf120Q7Z4R8 191 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 VTCN1Q7Z7D3 282 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM71CQ8NEG0 241 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 PROKR2Q8NFJ6 384 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF350Q9GZX5 532 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 SLC22A4Q9H015 551 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-207ENST00000484547 CA10Q9NS85 328 aa10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms