RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 DHHO43323 396 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SYNGR3O43761 229 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SLC19A2O60779 497 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ARL6IP5O75915 188 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 KRT8P05787 483 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GYPBP06028 91 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 KLK2P20151 261 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PTNP21246 168 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ALDH3B1P43353 468 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MAGEA5P43359 124 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PPIAP62937 165 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ECH1Q13011 328 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SLC10A1Q14973 349 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 LINGO2Q7L985 606 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CCDC36Q8IYA8 594 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 DEDD2Q8WXF8 326 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 AMELYQ99218 206 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MIXL1Q9H2W2 232 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 LRP12Q9Y561 859 aa5.69□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CLDN25C9JDP6 229 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CALCBP10092 127 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF12P17014 697 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 COX5AP20674 150 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OR3A2P47893 321 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TDGF1P3P51864 188 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PPP5CP53041 499 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CLRN1P58418 232 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PPP3R1P63098 170 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 RAB35Q15286 201 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF181Q2M3W8 571 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 C1orf100Q5SVJ3 147 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 LIPNQ5VXI9 398 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF511Q8NB15 262 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GHSRQ92847 366 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 WNT2BQ93097 391 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TSSK2Q96PF2 358 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 C1orf198Q9H425 327 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 FBXL3Q9UKT7 428 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SLC22A13Q9Y226 551 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ETV7Q9Y603 341 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM8BA6NDV4 472 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 AHRRA9YTQ3 701 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 C11orf98E9PRG8 122 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 H3BML4 177 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 LDLRAD4O15165 306 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TMCC2O75069 709 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZFPL1O95159 310 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 TFPIP10646 304 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 BMP4P12644 408 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 NR4A2P43354 598 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CSNK1A1P48729 337 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 BMXP51813 675 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 CAPZA1P52907 286 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF544Q6NX49 715 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 UTS2BQ765I0 119 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 RNF217Q8TC41 542 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 HES7Q9BYE0 225 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 HMG20AQ9NP66 347 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 MED29Q9NX70 200 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF224Q9NZL3 707 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 A0A1B0GTI1 187 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PDCD5O14737 125 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 APOC1P02654 83 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OPRM1P35372 400 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 RIDAP52758 137 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 WDR38Q5JTN6 314 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 VASH2Q86V25 355 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 OR5M1Q8NGP8 315 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 SETD6Q8TBK2 473 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 ABCG5Q9H222 651 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GPR35Q9HC97 309 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 B3GNT2Q9NY97 397 aa5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PRKCI-202ENST00000476635 LIPGQ9Y5X9 500 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.9 ms