RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 V9GYY5 206 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A087WYN8 130 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PQ72 361 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CST4P01036 141 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 HPGDP15428 266 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 AK4P27144 223 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 BTCP35070 178 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 OR3A4PP47883 348 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R19P59542 299 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC39A6Q13433 755 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6V1FQ16864 119 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBED5Q49AG3 693 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2UQ5VVX9 321 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 UNC93AQ86WB7 457 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SNX31Q8N9S9 440 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 DUSP18Q8NEJ0 188 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 OR6N2Q8NGY6 317 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 LGALS14Q8TCE9 139 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8D1Q8WZ84 308 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 COL21A1Q96P44 957 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM14Q96QK8 99 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGDIGQ99819 225 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 MICU1Q9BPX6 476 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CALN1Q9BXU9 219 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 NDEL1Q9GZM8 345 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SYT4Q9H2B2 425 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CLCF1Q9UBD9 225 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRK1Q38SD2 2015 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 JCADQ9P266 1359 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 MGAT4DA6NG13 374 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 H0YHG0 523 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CBR3O75828 277 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SC5DO75845 299 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SRP72O76094 671 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CDK14O94921 469 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 IL32P24001 234 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 MDH2P40926 338 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CSNK1DP48730 415 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 MXD1Q05195 221 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 UNC119Q13432 240 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ARFRP1Q13795 201 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 TNXAQ16473 311 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFAF6Q330K2 333 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF470Q6ECI4 717 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CGB2Q6NT52 195 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 C12orf54Q6X4T0 127 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 HORMAD1Q86X24 394 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2AP1Q8NGE2 309 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ARPC1AQ92747 370 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CDKL2Q92772 493 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 FCRL1Q96LA6 429 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CATSPER2Q96P56 530 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 UGT1A7Q9HAW7 530 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 UGT1A8Q9HAW9 530 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 PARVGQ9HBI0 331 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 UBAP1Q9NZ09 502 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CD274Q9NZQ7 290 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A15Q9Y619 301 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0J9YWU9 116 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GVI7 797 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 HACD1B0YJ81 288 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ERI3O43414 337 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CRLF1O75462 422 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3-23P01764 117 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 RHOCP08134 193 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 GKN3PP0CG01 181 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 GFAPP14136 432 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB7AP51149 207 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA0087Q14695 138 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 GSG1Q2KHT4 349 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR82Q6UXN9 313 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF677Q86XU0 584 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 WDSUB1Q8N9V3 476 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4F15Q8NGB8 312 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 OR6K6Q8NGW6 343 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 DDI1Q8WTU0 396 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 APH1BQ8WW43 257 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 DYNLL2Q96FJ2 89 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SOSTQ9BQB4 213 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ULBP2Q9BZM5 246 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB127Q9H1M4 99 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF702PQ9H963 129 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 SH2D2AQ9NP31 389 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM9BQ9NQ34 198 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2S2Q9NQN1 319 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 MS4A12Q9NXJ0 267 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC2DQ9UHP7 191 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms