RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 RDH16O75452 317 aa12.21□□□□□ -0.46
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SH3BP1-206ENST00000469947 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
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SH3BP1-206ENST00000469947 NUP210LQ5VU65 1888 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 C9orf170A2RU37 121 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 C11orf98E9PRG8 122 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 F8VVB4 439 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 F8VWA3 439 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP1-206ENST00000469947 I3L1I5 382 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
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