RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 KCNE3Q9Y6H6 103 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 LNP1A1A4G5 178 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FRG2CA6NGY1 282 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FADS1O60427 444 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TMEM127O75204 238 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CRABP1P29762 137 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP54-210ENST00000466048 PCBD1P61457 104 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP54-210ENST00000466048 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP54-210ENST00000466048 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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USP54-210ENST00000466048 KCNK2O95069 426 aa6.96□□□□□ -1.29
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USP54-210ENST00000466048 ZNF91Q05481 1191 aa6.96□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CHAF1BQ13112 559 aa6.96□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
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USP54-210ENST00000466048 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa6.96□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 YIPF6Q96EC8 236 aa6.96□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.96□□□□□ -1.29
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USP54-210ENST00000466048 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.96□□□□□ -1.29
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USP54-210ENST00000466048 B4DXG7 233 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ITGB2P05107 769 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 UBE2KP61086 200 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OR1Q1Q15612 314 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 TMEM239Q8WW34 195 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC7A7Q9UM01 511 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 OR6C6A6NF89 314 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 FOXS1O43638 330 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 FZD7O75084 574 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 UTS2O95399 124 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CBX7O95931 251 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RECKO95980 971 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CSF3P09919 207 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GABRB1P18505 474 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 AMY2BP19961 511 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PTGER1P34995 402 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 LIMK1P53667 647 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PPP1CAP62136 330 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP54-210ENST00000466048 MGAT2Q10469 447 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CAMK2DQ13557 499 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ZNF141Q15928 474 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RTL6Q6ICC9 239 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 EXD3Q8N9H8 876 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RNF128Q8TEB7 428 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 THEM6Q8WUY1 208 aa6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.96□□□□□ -1.3
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