RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	TREM2	Q9NZC2	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A0G2JND7	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PI15	O43692	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ENTPD5	O75356	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	C1orf105	O95561	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ANXA5	P08758	320 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CT62	P0C5K7	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	RSPH10B	P0C881	870 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC166	P0CW27	439 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	TBP	P20226	339 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	GDF1	P27539	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	GTF2H1	P32780	548 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	NAMPT	P43490	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	NOV	P48745	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	FBXW4	P57775	412 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ERVK-25	P63136	954 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MED21	Q13503	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PRR4	Q16378	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	RILP	Q96NA2	401 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	OR8B4	Q96RC9	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	SORT1	Q99523	831 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	RAB29	O14966	203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CHMP2A	O43633	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PROSC	O94903	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	KLHL2	O95198	593 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ZP3	P21754	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	GCLM	P48507	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MARCKSL1	P49006	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	RAP1GDS1	P52306	607 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MARC1	Q5VT66	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	NR4A3	Q92570	626 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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